Серийный интервал и генерационное время

Генерационное время — это интервал между заражением первичного случая и заражением вызванных им вторичных случаев, тогда как серийный интервал — это интервал между появлением симптомов у первичного случая и у его вторичных случаев. Поскольку время заражения обычно не наблюдается, серийный интервал является тем, что может быть измерено эпидемиологическим надзором, и используется в качестве практической замены генерационного времени; обе величины связывают время передачи инфекции с оценкой скорости распространения заболевания.

Definition

Генерационное время — это время между заражением случая и заражением людей, которых он заражает; серийный интервал — это время между появлением симптомов у случая и появлением симптомов у людей, которых он заражает, используемое в качестве наблюдаемой замены генерационного времени.

Scope

Эта статья разграничивает генерационное время и серийный интервал, объясняет, как каждый из них связан с инкубационным и инфекционным периодами, и описывает, как эти временные показатели связывают скорость роста эпидемии с репродуктивным числом. Это методологическая справочная тема, а не клиническое руководство.

Core questions

• В чем различие между генерационным временем и серийным интервалом и почему это различие важно?
• Как эти интервалы соотносятся с инкубационным периодом и инфекционным периодом?
• Как распределение серийного интервала используется для оценки репродуктивного числа?
• Почему генерационное время обычно оценивается, а не наблюдается напрямую?

Key concepts

• Генерационное время (генерационный интервал)
• Серийный интервал
• Инкубационный период
• Латентный и инфекционный периоды
• Распределение серийного интервала
• Скорость роста эпидемии
• Оценка репродуктивного числа по временным показателям

Key theories

Генерационный интервал и связь между скоростью роста и R

Валлинга и Липсич показали, что форма распределения генерационного интервала определяет, как наблюдаемая скорость роста эпидемии преобразуется в репродуктивное число, поэтому временные показатели необходимы для интерпретации трансмиссивности.

Mechanisms

Время передачи инфекции определяется естественным ходом инфекции: после заражения наступает латентный период до того, как хозяин становится заразным, и инкубационный период до появления симптомов, а хозяин передает инфекцию в течение своего инфекционного периода. Генерационное время измеряет интервал от заражения до заражения, тогда как серийный интервал измеряет интервал от появления симптомов до появления симптомов; эти два показателя в среднем совпадают при определенных допущениях, но различаются по дисперсии. Поскольку время заражения редко наблюдается, аналитики используют распределение серийного интервала вместе со скоростью роста эпидемии для оценки репродуктивного числа, включая методы, которые восстанавливают вероятности «кто кого заразил» или изменяющиеся во времени репродуктивные числа на основе данных о начале заболевания.

Clinical relevance

Временные показатели позволяют аналитикам преобразовывать наблюдаемые кривые случаев в оценки трансмиссивности и судить о том, как быстро растет вспышка. Они являются справочными величинами, описывающими процесс передачи и генерацию эпидемиологических оценок, а не основой для индивидуальных диагностических или лечебных решений.

Epidemiology

Оценочные серийные интервалы и генерационное время варьируются в зависимости от патогена и зависят от мер контроля, которые сокращают инфекционный период; обзоры инкубационных периодов для респираторных вирусов иллюстрируют, как время естественного течения заболевания различается у разных агентов, а анализы SARS использовали данные о начале заболевания для оценки трансмиссивности. Поэтому сообщаемые интервалы специфичны для патогена и условий.

History

Идея интервала между последовательными случаями давно существует в эпидемиологии и была уточнена в работе Файна, разграничивающей серийный интервал и лежащее в его основе время передачи. В 2000-х годах работы Валлинги и коллег формализовали роль генерационного интервала в связывании темпов роста с репродуктивными числами и разработали практические методы оценки с использованием данных о начале заболевания, с последующими программными фреймворками для изменяющихся во времени репродуктивных чисел.

Debates

Может ли серийный интервал безопасно заменять генерационное время?

Серийный интервал наблюдаем, но может отличаться от генерационного интервала по дисперсии и даже быть отрицательным при досимптомной передаче, поэтому его использование в качестве замены может смещать оценки репродуктивного числа, если различие не учитывается.

Key figures

• Jacco Wallinga
• Marc Lipsitch
• Paul Fine
• Anne Cori
• Justin Lessler

Seminal works

• wallinga-lipsitch-2007
• wallinga-teunis-2004
• fine-2003

Frequently asked questions

В чем разница между серийным интервалом и генерационным временем?

Генерационное время измеряется между событиями заражения, тогда как серийный интервал измеряется между моментами появления симптомов; серийный интервал наблюдаем и используется в качестве замены, поскольку время заражения обычно неизвестно.

Почему эти интервалы используются для оценки репродуктивного числа?

Распределение времени между последовательными заражениями связывает наблюдаемую скорость роста эпидемии с числом вторичных случаев на один случай, поэтому оно необходимо для преобразования скорости роста числа случаев в репродуктивное число.