Вызов пиков при одноядерном ChIP-seq — Эпигеномное профилирование scChIP-seq
Вызов пиков при одноядерном ChIP-seq — это биоинформатический конвейер, который идентифицирует геномные области, обогащенные модификациями гистонов или связыванием факторов транскрипции в отдельных клетках. Профилируя состояния хроматина с разрешением до отдельной клетки, он выявляет эпигеномную гетерогенность, скрытую в экспериментах с использованием объемного ChIP-seq, позволяя исследователям картировать регуляторные ландшафты различных клеточных популяций в пределах сложного образца ткани.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Вызов пиков ChIP-seqБиоинформатика↔ сравнить
- Полногеномное ассоциативное исследование эпигенома (EWAS)Биоинформатика↔ сравнить
- Одноклеточное эпигеном-широкое исследование ассоциаций (scEWAS)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравнить
- Выравнивание одноклеточных последовательностейБиоинформатика↔ сравнить
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →