Analiza de îmbogățire a seturilor de gene pe serii de timp — Îmbogățirea dinamică a căilor metabolice în puncte de timp
Analiza de îmbogățire a seturilor de gene pe serii de timp (TS-GSEA) extinde cadrul clasic GSEA pentru a detecta seturi de gene coordonate biologic — căi metabolice, termeni de ontologie genică sau semnături curate — ale căror expresii colective se modifică semnificativ în timp. În loc să compare două instantanee, modelează traiectoria temporală completă a expresiei genice pentru a identifica ce programe funcționale sunt activate, suprimate sau remodelate dinamic în timpul unui proces biologic, cum ar fi dezvoltarea, răspunsul la tratament sau progresia bolii.
Citește metoda completă
Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.
Harta metodelor
Vecinătatea metodelor înrudite — selectați un nod pentru a explora.
Surse
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Cum se citează această pagină
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Ce metodă?
Așezați această metodă lângă cele mai apropiate rude și citiți-le alăturat — biblioteca pune cărțile pe masă; alegerea vă aparține.
- Analiza de îmbogățire a seturilor de gene (GSEA)Bioinformatică↔ compară
- Analiza de îmbogățire a seturilor de gene multi-omiceBioinformatică↔ compară
- Analiza de îmbogățire a căilor metaboliceBioinformatică↔ compară
- Expresia Diferențială RNA-seqBioinformatică↔ compară
- Analiza ARN-seq monocelularBioinformatică↔ compară
- Expresia diferențială a ARN-seq în serii de timpBioinformatică↔ compară
Similar methods
Ai observat o problemă pe această pagină? Raportează sau sugerează o corectură →