Analiza de îmbogățire a seturilor de gene la nivel de celulă unică — scGSEA
Analiza de îmbogățire a seturilor de gene la nivel de celulă unică (scGSEA) extinde analiza clasică GSEA pe țesuturi (bulk) la rezoluția celulelor individuale. În loc să testeze dacă un set de gene este îmbogățit într-o comparație la nivel de eșantion, scGSEA atribuie un scor de îmbogățire sau activitate fiecărei celule, permițând cercetătorilor să cartografieze activitatea căilor metabolice (pathway) în populații celulare heterogene, stări celulare și traiectorii de dezvoltare capturate în date de tip RNA-seq la nivel de celulă unică.
Citește metoda completă
Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.
Harta metodelor
Vecinătatea metodelor înrudite — selectați un nod pentru a explora.
Surse
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Cum se citează această pagină
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Ce metodă?
Așezați această metodă lângă cele mai apropiate rude și citiți-le alăturat — biblioteca pune cărțile pe masă; alegerea vă aparține.
- Analiza de îmbogățire a seturilor de gene (GSEA)Bioinformatică↔ compară
- Analiza de îmbogățire a căilor metaboliceBioinformatică↔ compară
- Expresia Diferențială RNA-seqBioinformatică↔ compară
- Analiza ARN-seq monocelularBioinformatică↔ compară
- Analiza expresiei diferențiale în secvențierea ARN pe celulă unicăBioinformatică↔ compară
Citat de
Similar methods
Ai observat o problemă pe această pagină? Raportează sau sugerează o corectură →