Classificação Enzimática e Numeração EC

A classificação enzimática organiza as milhares de enzimas conhecidas pelas reações químicas que catalisam, em vez de pela sua estrutura ou origem. O sistema de numeração da Comissão Enzimática (EC) atribui a cada atividade catalítica um número de quatro partes, fornecendo a biólogos e clínicos um rótulo único e independente da linguagem para cada enzima caracterizada.

Definition

A numeração EC é uma classificação hierárquica, mantida pela IUBMB, na qual cada atividade enzimática recebe um número de quatro partes (por exemplo, EC 1.1.1.1) que codifica sua classe de reação, subclasse, sub-subclasse e identificador serial.

Scope

A entrada aborda o princípio da classificação baseada em reações, as sete classes EC de nível superior e o significado do número EC de quatro partes, a distinção entre um número EC (uma atividade) e um gene ou proteína, e os recursos curados que mantêm o sistema. É um tratamento de referência da nomenclatura enzimática, não uma orientação clínica.

Core questions

• Com base em que as enzimas são classificadas?
• O que representam as sete classes EC de nível superior?
• O que significa cada um dos quatro números em um código EC?
• Por que um número EC descreve uma atividade em vez de uma proteína específica?

Key concepts

• Classificação baseada em reações
• Número EC de quatro partes
• Sete classes EC (oxidorredutases, transferases, hidrolases, liases, isomerases, ligases, translocases)
• Nomes sistemáticos versus recomendados (triviais)
• Atividade versus identidade de gene/proteína
• Recursos de nomenclatura curados (ENZYME, BRENDA)

Mechanisms

Cada enzima é atribuída a uma das sete classes de nível superior pelo tipo de reação que catalisa: oxidorredutases (classe 1), transferases (2), hidrolases (3), liases (4), isomerases (5), ligases (6) e translocases (7, adicionada em 2018). O número EC de quatro partes, então, restringe a descrição hierarquicamente, o primeiro dígito indicando a classe, os dois seguintes indicando a subclasse e a sub-subclasse (tipicamente a ligação ou grupo sobre o qual a enzima atua), e o quarto um número de série para a atividade específica. Como o código descreve uma reação, um único número EC pode corresponder a várias proteínas ou genes distintos, e uma proteína pode carregar mais de um número EC. O sistema é curado e atualizado pela IUBMB e distribuído através de recursos como o banco de dados ENZYME e BRENDA.

Clinical relevance

Os números EC fornecem os identificadores padrão usados para se referir a enzimas em bancos de dados, descrições de alvos de medicamentos e mapas de vias metabólicas, de modo que o sistema sustenta como as informações sobre enzimas são compartilhadas na biomedicina. Esta entrada explica a estrutura de nomenclatura e não é uma base para decisões de diagnóstico ou tratamento.

Evidence & guidelines

A classificação é definida pelas recomendações do Comitê de Nomenclatura da IUBMB e mantida em bancos de dados curados, incluindo ENZYME e BRENDA, que servem como referência autorizada para as atribuições EC.

History

Uma Comissão Enzimática internacional foi convocada em meados do século XX para organizar a proliferação de nomes de enzimas inconsistentes, e introduziu o esquema de numeração de quatro partes baseado em reações que a IUBMB mantém desde então. O sistema foi digitalizado no banco de dados ENZYME (Bairoch, 2000) e complementado por recursos funcionais como BRENDA (Jeske e colaboradores, 2019; Chang e colaboradores, 2021). Em 2018, uma sétima classe, as translocases, foi adicionada para acomodar enzimas que catalisam o movimento através de membranas.

Key figures

• Amos Bairoch
• Dietmar Schomburg

Seminal works

• bairoch-2000
• iubmb-recommendations-2013

Frequently asked questions

O que significam os quatro números em um código EC?

O primeiro número indica a classe ampla da reação, o segundo e o terceiro a restringem para a subclasse e sub-subclasse (geralmente a ligação ou grupo químico envolvido), e o quarto é um número de série que identifica a reação catalisada específica.

Um número EC identifica um único gene ou proteína?

Não. Um número EC nomeia uma atividade catalítica, portanto, o mesmo número pode ser aplicado a várias proteínas não relacionadas, e uma proteína pode ter múltiplos números EC se catalisar mais de uma reação.