Análise de Enriquecimento de Vias Baseada em Rede
A análise de enriquecimento de vias baseada em rede integra redes de interação molecular — interações proteína-proteína, grafos de sinalização ou redes regulatórias de genes — com medições ômicas para identificar vias biológicas que são alteradas coordenadamente em uma condição. Diferentemente das abordagens clássicas de super-representação ou enriquecimento de conjuntos de genes que tratam os genes de uma via como listas independentes, esta família de métodos propaga sinais através das arestas da rede, capturando a topologia das interações e descobrindo módulos desregulados que o enriquecimento por lista plana não detectaria.
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Fontes
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
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