Analiza filogenetyczna szeregów czasowych — Filogenetyka czasowa
Analiza filogenetyczna szeregów czasowych rekonstruuje historię ewolucyjną organizmów lub wariantów genetycznych przy użyciu sekwencji pobranych w znanych punktach czasowych. Włączając daty pobrania próbek bezpośrednio do modelu, szacuje ona czasy dywergencji, szybkości substytucji i relacje przodków w bezwzględnej skali czasowej — co czyni ją niezbędną do badania ognisk wirusowych, dynamiki starożytnego DNA i szybkiej ewolucji drobnoustrojów.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Mapa metod
Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.
Źródła
- Drummond, A. J., & Rambaut, A. (2007). BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees. BMC Evolutionary Biology, 7, 214. DOI: 10.1186/1471-2148-7-214 ↗
- Bouckaert, R., Vaughan, T. G., Barido-Sottani, J., Duchene, S., Fourment, M., Gavryushkina, A., et al. (2019). BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis. PLOS Computational Biology, 15(4), e1006650. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006650 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Phylogenetic Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/time-series-phylogenetic-analysis
Która metoda?
Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.
- Bayesian Phylogenetic AnalysisBioinformatyka↔ porównaj
- Badanie asocjacyjne całego genomu (GWAS)Bioinformatyka↔ porównaj
- Analiza filogenetycznaBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ porównaj
- Dopasowanie sekwencjiBioinformatyka↔ porównaj
- WariantyBioinformatyka↔ porównaj
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →