Rhizosphere Amplicon Analysis — Profilering av rotsonens mikrobiom

Rhizosphere Amplicon Analysis er en molekylærøkologisk arbeidsflyt som brukes til å karakterisere mikrobielle samfunn som lever i den rotnære jordsonen — rhizosfæren — ved å sekvensere målrettede markørgener som bakterielt 16S rRNA-gen eller soppens ITS-region. Metoden er mye brukt innen agronomi, jordøkologi og plantepatologi, og gjør det mulig for forskere å identifisere hvilke mikroorganismer som er til stede, hvordan deres sammensetning endres under ulike avlinger, behandlinger eller jordforhold, og hvordan samfunnsstrukturen er relatert til plantehelse og produktivitet.