ATAC-seq Analyse
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is een methode voor het profileren van het landschap van chromatine toegankelijkheid genoombreed. Ontwikkeld door Buenrostro en collega's in 2013, gebruikt ATAC-seq hyperactieve transposase om open, toegankelijke chromatine regio's te taggen, wat een snelle en gevoelige identificatie van regulatoire DNA-elementen mogelijk maakt. ATAC-seq is een standaardtechniek geworden voor het karakteriseren van gen-regulatorische landschappen, het ontdekken van celtype-specifieke regulatorische elementen en het afleiden van gen-regulatorische netwerken.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Bronnen
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Hi-C AnalyseGenetica↔ compare
- RNA VelocityGenetica↔ compare
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →