Hi-C Analyse
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) is een techniek en bijbehorende computationele methoden voor het in kaart brengen van de 3D-architectuur van het genoom binnen cellen. Ontwikkeld door Lieberman-Aiden en Dekker in 2009, identificeert Hi-C fysieke interacties tussen genomische regio's die lineair ver van elkaar kunnen liggen, maar ruimtelijk nabij zijn in de 3D-nucleaire ruimte. Hi-C analyse heeft fundamentele principes van genoomorganisatie onthuld, waaronder het bestaan van topologisch-associërende domeinen (TAD's), en biedt inzichten in hoe 3D-structuur genexpressie en DNA-replicatie reguleert.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Bronnen
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq AnalyseGenetica↔ compare
- RNA VelocityGenetica↔ compare
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →