ATAC-seq analīze
ATAC-seq (transpozāzes pieejamā hromatīna noteikšanas metode ar sekvenču palīdzību) ir metode, kas ļauj globāli profilēt hromatīna pieejamību. Buenrostro un kolēģu 2013. gadā izstrādātā ATAC-seq metode izmanto hiperaktīvu transpozāzi, lai atzīmētu atklātās, pieejamās hromatīna reģionus, nodrošinot ātru un jutīgu regulējošo DNS elementu identifikāciju. ATAC-seq ir kļuvusi par standarta tehniku gēnu regulējošo ainavu raksturošanai, šūnu tipam specifisku regulējošo elementu atklāšanai un gēnu regulējošo tīklu secināšanai.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Avoti
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Hi-C analīzeĢenētika↔ compare
- RNA ātrumsĢenētika↔ compare
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →