Hi-C analīze
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture – augstas izšķirtspējas hromosomu konformācijas notveršana) ir tehnika un ar to saistītas aprēķinu metodes genoma 3D arhitektūras kartēšanai šūnās. Lieberman-Aiden un Dekker 2009. gadā izstrādātā Hi-C identificē fiziskas mijiedarbības starp ģenomiskajiem reģioniem, kas var būt attālināti lineārajā secībā, bet telpiski tuvi 3D kodola telpā. Hi-C analīze ir atklājusi fundamentālus genoma organizācijas principus, tostarp topoloģiski asociēto domēnu (TAD) esamību, un sniedz ieskatu par to, kā 3D struktūra regulē gēnu ekspresiju un DNS replikāciju.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Avoti
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq analīzeĢenētika↔ compare
- RNA ātrumsĢenētika↔ compare
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →