Single-cell Copy Number Variation Analysis
Single-cell copy number variation (scCNV) analysis detects gains and losses of genomic segments within individual cells, enabling researchers to resolve intratumor heterogeneity, reconstruct clonal evolution, and distinguish malignant from normal cells at single-cell resolution. It can be applied to single-cell whole-genome sequencing data directly or inferred from read-depth signals in scRNA-seq or scATAC-seq experiments.
Avota reģistrs
Atsauces kopētas tieši no metodes avota reģistra. Tās nenozīmē nekādu apgalvojumu līmeņa verifikāciju.
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. · URL
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. · URL
Kurēti apgalvojumi
Apgalvojumi saglabāti pierādījumu reģistrā, katram ar savu novērtējumu.
Šis skatījums neizgudro apgalvojumu novērtējumu, ja reģistrā tā nav.
Saistītās metodes
Ģenerēts no metodes grafika un parādīts kā mašīnas ieteiktas attiecības — netiek izvirzīts neviens pierādījumu apgalvojums.