PPI tīkla topoloģija
Olbaltumvielu-olbaltumvielu mijiedarbības tīklu analīze identificē un raksturo šūnu mijiedarbības tīklu strukturālās īpašības. Šo pieeju aizsāka Uetz un kolēģi, izmantojot liela mēroga rauga divu hibrīdu skrīningu; tā atklāj tādas topoloģiskas iezīmes kā centri (hubs), moduļi un motīvi, kas kodē funkcionālo organizāciju un slimību asociācijas.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Metožu karte
Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.
Avoti
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/ppi-network-topology
Kura metode?
Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.
- Rekonstrukcija ar krioelektronmikroskopijuBioinformātika↔ salīdzināt
- HMMER profila meklēšanaBioinformātika↔ salīdzināt
- Molekulārā dokēšanaBioinformātika↔ salīdzināt
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →