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ATAC-seq Analysis/증거
방법 증거 기록

ATAC-seq Analysis

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and colleagues in 2013, ATAC-seq uses hyperactive transposase to tag open, accessible chromatin regions, enabling rapid and sensitive identification of regulatory DNA elements. ATAC-seq has become a standard technique for characterizing gene regulatory landscapes, discovering cell-type-specific regulatory elements, and inferring gene regulatory networks.

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원본 기록

방법의 원본 기록에서 그대로 복사된 인용입니다. 이로부터 수준별 검증이 추론되지 않습니다.

ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes
분류학적 방법 기록 · process-pipeline / genetics
  • Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. · URL
  • Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. · DOI 10.1038/ng.3646
  • Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. · URL
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큐레이션된 주장

각각 자체 평가와 함께 증거 원장에 유지된 주장입니다.

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관련 방법

방법 그래프에서 생성되었으며 기계가 제안한 관계로 표시됩니다 — 증거 주장이 추론되지 않습니다.

Same method familyHi-C Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyRNA Velocitymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

증거 상태

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

출처

방법 원본 기록에서 복사된 기록된 인용 3개.

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