Process / pipelineSystems biology
PPIネットワークトポロジー
タンパク質間相互作用(PPI)ネットワーク解析は、細胞内相互作用ネットワークの構造的特性を特定し、特徴づけます。Uetzらが大規模な酵母ツーハイブリッドスクリーニングを通じて開拓したこのアプローチは、機能的組織化と疾患関連性を符号化するハブ、モジュール、モチーフといったトポロジー的特徴を明らかにします。
手法の全文を読む
会員限定
ログイン無料アカウントでログインすると、このセクションを読めます。
手法マップ
関連する手法の近傍 — ノードを選択して探索できます。
出典
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/ppi-network-topology
どの手法を選ぶ?
この手法を最も近い類縁の手法と並べ、両者を見比べてください — ライブラリは本を机の上に並べるだけ。選ぶのはあなたです。
- クライオ電子顕微鏡再構成バイオインフォマティクス↔ 比較
- HMMER プロファイル検索バイオインフォマティクス↔ 比較
- 分子ドッキングバイオインフォマティクス↔ 比較