Zygomycetes dan Divisi Fungi Lainnya

Zygomycetes adalah pengelompokan historis fungi yang tumbuh cepat, sebagian besar filamen, secara tradisional didefinisikan oleh pembentukan spora seksual berdinding tebal yang disebut zigospora. Filogenetika molekuler telah menunjukkan bahwa filum lama 'Zygomycota' bukanlah satu garis keturunan alami, dan anggotanya telah ditetapkan kembali ke filum Mucoromycota dan beberapa filum terkait, bersama dengan divisi-divisi lain yang menyimpang awal dari kingdom fungi.

Definition

Zygomycetes adalah fungi filamen senositik (sebagian besar non-septat) yang secara historis dikelompokkan berdasarkan produksi zigospora; pengelompokan ini sekarang diakui sebagai non-monofiletik, anggotanya didistribusikan terutama di antara Mucoromycota dan filum-filum awal terkait daripada satu filum Zygomycota.

Scope

Topik ini mencakup fungi zygomycete dan divisi non-Dikarya lainnya dari kingdom Fungi. Ini menjelaskan zigospora sebagai ciri khas historis, alasan mengapa kelompok tersebut dipecah oleh filogenetika skala genom, dan posisi garis keturunan awal yang terkait. Ordo Mucorales yang secara klinis penting diperlakukan sebagai jangkar MeSH utama. Entri ini adalah tinjauan referensi dan tidak memberikan panduan diagnostik atau pengobatan.

Core questions

• Apa itu zigospora dan mengapa ia mendefinisikan zygomycetes historis?
• Mengapa filum 'Zygomycota' ditinggalkan sebagai kelompok alami?
• Bagaimana zygomycetes sebelumnya didistribusikan di antara Mucoromycota dan filum-filum terkait saat ini?
• Bagaimana divisi fungi yang menyimpang awal berbeda dari Dikarya?

Key concepts

• Zigospora
• Hifa senositik (sebagian besar aseptat)
• Sporangia dan sporangiospora
• Ordo Mucorales
• Filum Mucoromycota
• Non-monofili dari 'Zygomycota'
• Garis keturunan fungi yang menyimpang awal (basal)
• Hifa lebar, seperti pita, non-septat dalam jaringan

Mechanisms

Zygomycetes klasik membentuk zigospora ketika dua hifa yang kompatibel menyatu, dan mereka biasanya bereproduksi secara aseksual oleh sporangiospora yang dihasilkan di dalam sporangium; hifa mereka lebar dan sebagian besar tanpa dinding silang (senositik). Analisis filogenetik skala genom menunjukkan bahwa taksa yang memiliki ciri-ciri ini tidak membentuk satu klad tunggal, mendorong reklasifikasi mereka ke dalam filum Mucoromycota dan beberapa filum terkait daripada satu filum Zygomycota (Spatafora et al., 2016), menyempurnakan skema tingkat tinggi sebelumnya dari Hibbett et al. (2007). Hifa fungi ini yang lebar dan jarang bersekat memberikan penampilan yang khas pada sediaan jaringan (Guarner & Brandt, 2011).

Clinical relevance

Anggota ordo Mucorales adalah agen mukormikosis, infeksi invasif yang biologinya membantu menjelaskan mengapa sulit untuk ditangani (Katragkou et al., 2014), dan hifa lebar, seperti pita, dan jarang bersekat yang khas membantu pengenalannya dalam histopatologi (Guarner & Brandt, 2011). Entri ini menjelaskan klasifikasi dan morfologi yang membuat fungi ini dapat diidentifikasi dan bukan merupakan sumber rekomendasi diagnostik atau terapeutik individual.

Evidence & guidelines

Klasifikasi zygomycetes sebelumnya saat ini mengikuti revisi tingkat filum skala genom oleh Spatafora et al. (2016), dibandingkan dengan skema seluruh kingdom sebelumnya oleh Hibbett et al. (2007). Konteks klinis dan histopatologis untuk Mucorales diambil dari Guarner dan Brandt (2011) serta Katragkou et al. (2014).

History

Sepanjang sebagian besar abad kedua puluh, filum Zygomycota menyatukan fungi yang menghasilkan zigospora, dengan Mucorales sebagai ordo yang paling dikenal. Seiring dengan akumulasi filogeni berbasis DNA, kelompok tersebut terbukti merupakan kumpulan artifisial dari beberapa garis keturunan yang berbeda; klasifikasi tingkat tinggi Hibbett et al. (2007) telah menandai ketidakstabilan ini, dan analisis skala genom Spatafora et al. (2016) secara formal menggantikan 'Zygomycota' dengan Mucoromycota dan filum-filum terkait.

Debates

Apakah 'Zygomycota' merupakan filum yang valid?

Filogenetika skala genom menunjukkan bahwa fungi pembentuk zigospora tidak memiliki satu nenek moyang yang sama secara eksklusif, sehingga filum tersebut dibubarkan dan anggotanya ditetapkan kembali ke Mucoromycota dan filum-filum terkait; nama lama tetap digunakan secara informal.

Key figures

• Joseph W. Spatafora
• Gerald L. Benny
• David Hibbett
• Jason E. Stajich

Seminal works

• spatafora-2016
• hibbett-2007

Frequently asked questions

Apakah 'Zygomycota' masih merupakan filum yang diakui?

Tidak. Studi skala genom menunjukkan bahwa itu bukan satu garis keturunan alami, dan anggotanya telah ditetapkan kembali terutama ke filum Mucoromycota dan beberapa filum awal terkait, meskipun istilah zygomycetes tetap digunakan secara informal.

Apa yang membedakan hifa zygomycete?

Hifa zygomycete umumnya lebar dan senositik, artinya mereka memiliki sedikit atau tidak ada dinding silang (septa), yang memberi mereka penampilan khas lebar, seperti pita, dibandingkan dengan hifa Dikarya yang bersekat secara teratur.