RNA Velocity
Az RNA velocity egy számítási módszer, amely az egyedi sejtek jövőbeli fejlődési állapotát inferálja egér-RNA-szekvenálási (scRNA-seq) adatokból. A La Manno és munkatársai által 2018-ban kifejlesztett RNA velocity analízis a sejtállapot-átmenetek irányát és sebességét méri az egyedi sejteken belüli nem-splicelődött (unspliced) és splicelődött (spliced) mRNS transzkriptumok arányának elemzésével. Ez lehetővé teszi a sejt-trajektóriák és differenciálódási utak előrejelzését időbeli mintavételezés vagy manipuláció nélkül, egyedi betekintést nyújtva a sejt-sors döntésekbe fejlődés és betegség során.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Módszertérkép
A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.
Források
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/genetics/rna-velocity
Melyik módszer?
Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.
- ATAC-seq analízisGenetika↔ összehasonlítás
- Hi-C analízisGenetika↔ összehasonlítás
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →