ATAC-seq analízis
Az ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) egy módszer a kromatin hozzáférhetőségének genom-szintű profilozására. A Buenrostro és munkatársai által 2013-ban kifejlesztett ATAC-seq hiperaktív transzpozázt használ a nyitott, hozzáférhető kromatin régiók megjelölésére, lehetővé téve a szabályozó DNS-elemek gyors és érzékeny azonosítását. Az ATAC-seq standard technikává vált a génszabályozó tájképek jellemzésére, a sejttípus-specifikus szabályozó elemek felfedezésére és a génszabályozó hálózatok feltérképezésére.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Források
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Hi-C analízisGenetika↔ compare
- RNA VelocityGenetika↔ compare
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →