Hi-C analízis
A Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) egy olyan technika és a hozzá kapcsolódó számítási módszerek összessége, amely a genom sejten belüli 3D-s architektúrájának feltérképezésére szolgál. A Lieberman-Aiden és Dekker által 2009-ben kifejlesztett Hi-C azonosítja a genomi régiók közötti fizikai kölcsönhatásokat, amelyek lineáris szekvenciában távoliak lehetnek, de térben közel állnak egymáshoz a 3D-s nukleáris térben. A Hi-C analízis feltárta a genom szerveződésének alapvető elveit, beleértve a topológiailag asszociált domének (TAD-ok) létezését, és betekintést nyújt abba, hogy a 3D-s struktúra hogyan szabályozza a génexpressziót és a DNS-replikációt.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Források
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq analízisGenetika↔ compare
- RNA VelocityGenetika↔ compare
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →