Time-series gene set enrichment analysis
Time-series gene set enrichment analysis (TS-GSEA) extends the classical GSEA framework to detect biologically coordinated gene sets — pathways, gene ontology terms, or curated signatures — whose collective expression changes meaningfully over time. Rather than comparing two snapshots, it models the full temporal trajectory of gene expression to identify which functional programs are activated, suppressed, or dynamically remodelled during a biological process such as development, treatment response, or disease progression.
רשומת מקור
ציטוטים הועתקו מילה במילה מרשומת המקור של המתודה. לא מוסקת כל אימות ברמת הטענה מהם.
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. · DOI 10.1073/pnas.0506580102
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. · DOI 10.1093/bioinformatics/btu333
טענות מאוצרות
טענות שנשמרו ביומן הראיות, לכל אחת הערכה משלה.
תצוגה זו אינה ממציאה הערכת טענה כאשר ליומן אין אחת.
מתודות קשורות
נוצר מגרף המתודות ומוצג כיחסים שהוצעו על ידי המכונה — לא מוסקת כל טענת ראיה.