Parasitologie quantitative et échantillonnage épidémiologique

La parasitologie quantitative mesure l'ampleur du parasitisme présent, et non pas seulement la détection d'un parasite. Elle standardise des termes tels que la prévalence, l'intensité et l'abondance, et les associe à des méthodes d'échantillonnage sur le terrain et de comptage afin que la charge parasitaire puisse être comparée entre individus, populations et au fil du temps, et utilisée pour guider et évaluer les programmes de contrôle.

Definition

La parasitologie quantitative et l'échantillonnage épidémiologique constituent l'ensemble des mesures standardisées, des techniques de comptage et des principes de conception d'enquêtes utilisés pour estimer la prévalence, l'intensité et la distribution de l'infection parasitaire dans les populations hôtes.

Scope

Ce sujet couvre le vocabulaire standardisé de la mesure de l'infection, les techniques de comptage des œufs et des parasites utilisées pour estimer l'intensité, ainsi que les considérations d'échantillonnage qui façonnent les enquêtes épidémiologiques, y compris la distribution nettement surdispersée (agrégée) des parasites chez les hôtes. Il est présenté comme une méthodologie quantitative et épidémiologique et ne fournit pas de protocoles de tests cliniques ou de traitement.

Core questions

• Comment la prévalence, l'intensité et l'abondance sont-elles définies et distinguées ?
• Comment l'intensité de l'infection est-elle quantifiée, par exemple en œufs par gramme de selles ?
• Pourquoi les parasites sont-ils généralement agrégés chez les hôtes, et comment cela affecte-t-il l'échantillonnage ?
• Comment la sensibilité des tests diagnostiques et l'effort d'échantillonnage biaisent-ils les estimations de la charge parasitaire ?

Key concepts

• Prévalence, intensité et abondance
• Intensité moyenne versus abondance moyenne
• Œufs par gramme (OPG) de selles
• Méthodes de comptage des œufs (par exemple, Kato-Katz)
• Surdispersion et agrégation des parasites chez les hôtes
• Effort d'échantillonnage et probabilité de détection
• Estimation en l'absence d'un véritable étalon-or

Mechanisms

La quantification commence par un vocabulaire commun : la prévalence est la proportion d'hôtes infectés, l'intensité est la charge parasitaire chez les hôtes infectés, et l'abondance est la moyenne de la charge sur l'ensemble des hôtes examinés, infectés ou non. L'intensité est couramment estimée en comptant les stades parasitaires dans un spécimen standardisé, tel que les œufs par gramme de selles à partir d'une préparation de frottis épais calibré. Étant donné que les parasites sont généralement agrégés, la plupart des hôtes en portant peu et une minorité en portant beaucoup, les statistiques récapitulatives et l'échantillonnage doivent tenir compte de cette asymétrie. Les estimations de la prévalence et de l'intensité sont sensibles à la limite de détection de la méthode diagnostique et au nombre de spécimens examinés ; la conception de l'échantillonnage et la sensibilité imparfaite des tests sont donc essentielles pour une estimation fiable de la charge parasitaire.

Clinical relevance

Les mesures quantitatives standardisées permettent aux programmes de santé publique de classer les communautés en fonction de l'intensité de l'infection, de cibler les interventions et de suivre les changements au fil du temps ; la compréhension de ces mesures fait partie de l'interprétation des données des enquêtes parasitologiques. Cette entrée décrit la méthodologie de mesure et d'échantillonnage comme une preuve et ne constitue pas une base pour des décisions individuelles de diagnostic ou de traitement.

Epidemiology

Les méthodes d'enquête quantitatives sous-tendent les estimations de la charge mondiale, comme la découverte que les helminthes transmis par le sol ont infecté bien plus d'un milliard de personnes, et les travaux méta-analytiques montrent que la sensibilité imparfaite et dépendante de l'intensité des tests diagnostiques doit être modélisée plutôt qu'ignorée lors de l'estimation de ces charges.

History

La quantification standardisée des œufs dans les selles a été améliorée par la technique du frottis épais calibré introduite au début des années 1970, qui a rendu les estimations d'œufs par gramme reproductibles entre les études. La terminologie de la prévalence, de l'intensité et de l'abondance a été consolidée pour la parasitologie écologique et médicale dans une synthèse influente de 1997, et des programmes d'enquête à grande échelle ont ensuite combiné ces mesures pour cartographier la charge helminthique mondiale et guider le contrôle.

Debates

Comment l'intensité de l'infection doit-elle être estimée lorsque les tests sont imparfaits ?

Le nombre d'œufs et la prévalence dépendent tous deux de la sensibilité diagnostique, qui diminue à de faibles intensités ; par conséquent, les estimations de la charge parasitaire dérivées d'un seul test peuvent être biaisées. Des approches statistiques qui ne supposent pas un étalon-or parfait sont utilisées pour corriger cela.

Seminal works

• bush-1997
• katz-1972
• pullan-2014

Frequently asked questions

Quelle est la différence entre la prévalence et l'intensité ?

La prévalence est la proportion d'une population infectée, tandis que l'intensité est la gravité de l'infection chez les personnes infectées ; les deux peuvent évoluer indépendamment et sont toutes deux importantes pour évaluer la charge parasitaire.

Pourquoi les parasites sont-ils décrits comme agrégés chez les hôtes ?

Dans la plupart des populations, quelques hôtes portent la majorité des parasites tandis que beaucoup en portent peu ou pas du tout ; la distribution est donc surdispersée plutôt qu'uniforme, ce qui affecte la manière dont la charge est résumée et dont les échantillons sont prélevés.