Appel de pics par ChIP-seq bayésien — Détection probabiliste d'enrichissement dans les données épigénomiques

L'appel de pics par ChIP-seq bayésien applique des modèles probabilistes — typiquement des modèles de Poisson, binomial négatif ou de Markov cachés avec inférence bayésienne — pour détecter les régions génomiques enrichies pour une protéine d'intérêt dans des expériences d'immunoprécipitation de la chromatine suivie d'un séquençage. En modélisant explicitement le bruit des comptages de lectures et en incorporant des distributions à priori, les appelants bayésiens fournissent des probabilités a posteriori d'enrichissement plutôt que de simples valeurs p, offrant un cadre principiel pour la quantification de l'incertitude à travers le génome.