Bakteeriviljelyalustat ja kasvatusolosuhteet

Bakteeriviljelyalustat ovat ravinnepohjia, joilla kliinisiä bakteereita kasvatetaan, ja kasvatusolosuhteet ovat fysikaaliset ja ilmakehälliset asetukset, joissa niitä inkuboidaan. Yhdessä ne määrittävät, mitä organismeja laboratorio voi eristää näytteestä, ja niiden oikea valinta on viljelypohjaisen diagnostiikan perusta.

Definition

Bakteeriviljelyalustat ovat kiinteitä tai nestemäisiä substraatteja, jotka tarjoavat bakteerikasvulle välttämättömiä ravinteita, ja kasvatusolosuhteet ovat kontrolloituja fysikaalisia ja ilmakehällisiä parametreja, joiden vallitessa inokuloituja alustoja inkuboidaan kiinnostavien organismien eristämiseksi.

Scope

Aihe kattaa kliinisessä bakteriologiassa käytettävien alustojen koostumuksen ja luokat, mukaan lukien yleiskäyttöiset, rikastetut, selektiiviset ja differentiaalialustat, sekä inkubaatiomuuttujat, jotka vaikuttavat eristymiseen, kuten lämpötila, ilmakehä ja aika. Se käsittelee alustoja ja kasvatusolosuhteita metodologisena aiheena eikä anna kliinisiä ohjeita yksittäisille potilaille.

Core questions

• Mikä erottaa yleiskäyttöiset, rikastetut, selektiiviset ja differentiaalialustat toisistaan?
• Miten inkubaatiolämpötila, ilmakehä ja kesto vaikuttavat eristymiseen?
• Miksi jotkin bakteerit vaativat erityisiä alustoja tai ilmakehiä kasvaakseen?

Key concepts

• Rikastetut alustat
• Selektiiviset alustat
• Differentiaalialustat
• Aerobinen, anaerobinen ja kapnofiilinen inkubaatio
• Vaativat organismit
• Kiinteä versus liemi (nestemäinen) viljely
• Kromogeeniset alustat

Mechanisms

Alustat tarjoavat hiiltä, typpeä, suoloja ja kasvutekijöitä, ja niitä voidaan täydentää verellä tai muilla rikastajilla vaativien organismien tukemiseksi. Selektiiviset alustat sisältävät aineita, jotka estävät ei-toivottua mikrobistoa sallien samalla kohdeorganismien kasvun, ja differentiaalialustat sisältävät indikaattoreita, jotka paljastavat aineenvaihduntaominaisuuden auttaen erottamaan kolonioita. Kasvu riippuu myös inkubaatiosta: monet patogeenit kasvavat parhaiten ruumiinlämpöä lähellä, jotkut vaativat hiilidioksidipitoisen (kapnofiilisen) ilmakehän ja ehdottomat anaerobit vaativat hapen poissulkemista. Alustan ja ilmakehän sovittaminen epäiltyyn patogeeniin ja näytetyyppiin maksimoi eristymisen, minkä vuoksi laboratoriot räätälöivät viljelyasetukset kliiniseen kysymykseen (Baron 2013; Jorgensen 2015).

Clinical relevance

Alustojen ja olosuhteiden valinta selittää, miksi rutiiniviljely voi jättää huomiotta vaativat tai anaerobiset organismit, ellei erityisiä menetelmiä pyydetä, ja miksi organismin eristyminen riippuu siitä, ennakoiko laboratorio sen. Tämä ymmärrys tukee viljelyraporttien kriittistä lukemista; se kuvaa, miten tulokset tuotetaan, eikä se ole perusta yksittäisille diagnostisille tai hoitopäätöksille.

Evidence & guidelines

Vakiovertailutekstit kuvaavat viljelyalustojen ja inkubaatio-olosuhteiden formulointia ja käyttöä kliinisessä bakteriologiassa (Jorgensen 2015), ja käyttöohjeet yhdistävät näytetyypin asianmukaisiin viljelyasetuksiin (Baron 2013).

History

Kiinteät viljelyalustat mullistivat bakteriologian 1800-luvun lopulla mahdollistamalla puhtaiden kolonien eristämisen, ja rikastettujen, selektiivisten ja differentiaaliformulaatioiden myöhempi kehitys laajensi eristettävien ja erotettavien organismien kirjoa, mikä on standardimanuaaleihin (Jorgensen 2015) kodifioitua menetelmäkokonaisuutta.

Seminal works

• jorgensen-2015
• baron-2013

Frequently asked questions

Mikä on ero selektiivisten ja differentiaalialustojen välillä?

Selektiiviset alustat sisältävät aineita, jotka estävät ei-toivottuja organismeja, jotta kohdebakteerit voivat kasvaa, kun taas differentiaalialustat sisältävät indikaattoreita, jotka tekevät tietyllä aineenvaihduntaominaisuudella varustetuista koloista visuaalisesti erotettavia; yksi alusta voi olla molempia.

Miksi viljely voi olla negatiivinen, vaikka infektio olisi läsnä?

Vaativat, anaerobiset tai hitaasti kasvavat organismit eivät välttämättä kasva rutiinialustoilla tai tavallisissa ilmakehissä, joten eristyminen riippuu siitä, käyttääkö laboratorio epäillylle patogeenille sopivia alustoja ja inkubaatio-olosuhteita.