PPI-verkon topologia
Proteiini-proteiini-vuorovaikutusverkkojen analyysi tunnistaa ja karakterisoi solunsisäisten vuorovaikutusverkkojen rakenteellisia ominaisuuksia. Uetzin ja kollegoiden uraauurtavan suuren mittakaavan hiivakaksihybridiseulonnan avulla tämä lähestymistapa paljastaa topologisia piirteitä, kuten hub-proteiineja, moduuleja ja motiiveja, jotka koodaavat toiminnallista organisaatiota ja sairauksiin liittyviä yhteyksiä.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Menetelmäkartta
Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.
Lähteet
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/ppi-network-topology
Mikä menetelmä?
Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.
- Kryo-EM-rekonstruktioBioinformatiikka↔ vertaa
- HMMER-profiilihakuBioinformatiikka↔ vertaa
- MolekyylidokitusBioinformatiikka↔ vertaa
Tähän viittaavat
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →