Process / pipelineBioinformatics / omics

Bayesiläinen kopioanumeroanalyysi

Bayesiläinen kopioanumeroanalyysi (CNV) on todennäköisyyskehys genomisten segmenttien havaitsemiseksi, joissa yksilön DNA-kopioiden määrä poikkeaa diploidisesta normaalista. Asettamalla a priori -jakaumat kopioanumeroille ja päivittämällä niitä array CGH-, SNP-array- tai sekvensointilukemien syötteiden avulla, lähestymistapa tuottaa posterioritodennäköisyydet kullekin kopioanumeroasteelle genomissa, tarjoten tilastollisesti perusteltua epävarmuuden kvantifiointia, jota frekventistiset segmentointimenetelmät eivät tarjoa.

Avaa sovelluksessa MethodMindTulossaVideoTulossaDownload slides

Lue koko menetelmä

Vain jäsenille

Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.

Kirjaudu sisään

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Lähteet

  1. Colella, S., Yau, C., Taylor, J. M., Mirza, G., Butler, H., Clouston, P., Bassett, A. S., Seller, A., Holmes, C. C., & Ragoussis, J. (2007). QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data. Nucleic Acids Research, 35(6), 2013–2025. DOI: 10.1093/nar/gkm076
  2. Fridlyand, J., Snijders, A. M., Pinkel, D., Albertson, D. G., & Jain, A. N. (2004). Hidden Markov models approach to the analysis of array CGH data. Journal of Multivariate Analysis, 90(1), 132–153. DOI: 10.1016/j.jmva.2004.02.008

Näin viittaat tähän sivuun

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateBayesian Copy Number Variation Analysis (Bayesian Copy Number Variation Analysis). Haettu 2026-06-15 osoitteesta https://scholargate.app/fi/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis · Aineisto: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026