Rhizosfäärin amlikonianalyysi — Juurivyöhykkeen mikrobiston profilointi
Rhizosfäärin amlikonianalyysi on molekyyliekologinen työkalu, jota käytetään juuren läheisyydessä — rhizosfäärissä — elävien mikrobiyhteisöjen karakterisointiin sekvensoimalla kohdennettuja geenimarkkereita, kuten bakteerien 16S rRNA -geeniä tai sienten ITS-aluetta. Tätä menetelmää sovelletaan laajasti agronomiassa, maaperäekologiassa ja kasvitautiopissa, ja sen avulla tutkijat voivat tunnistaa läsnä olevat mikro-organismit, miten niiden koostumus muuttuu eri viljelykasvien, käsittelyjen tai maaperäolosuhteiden vaikutuksesta, ja miten yhteisön rakenne liittyy kasvien terveyteen ja tuottavuuteen.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Lähteet
- Lundberg, D. S., Lebeis, S. L., Paredes, S. H., Yourstone, S., Gehring, J., Malfatti, S., ... & Dangl, J. L. (2012). Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nature, 488(7409), 86-90. DOI: 10.1038/nature11237 ↗
- Berendsen, R. L., Pieterse, C. M., & Bakker, P. A. (2012). The rhizosphere microbiome and plant health. Trends in Plant Science, 17(8), 478-486. DOI: 10.1016/j.tplants.2012.04.001 ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis
Similar methods
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →