Environmental DNA Metabarcoding
Organismit vapauttavat jatkuvasti DNA:ta (ulosteiden, liman, ihon, hajoamisen kautta) ympäristöönsä. Suodattamalla vettä, maaperää tai sedimenttiä ja sekvensoimalla läsnä oleva sekoittunut DNA havaitaan kaikki lajit, jotka ovat asuttaneet näytealuetta. Esimerkiksi vesinäytteen eDNA havaitsee kaloja, sammakkoeläimiä ja selkärangattomia häiritsemättä elinympäristöä. Metakoodaus monistaa standardoidun geenialueen (viivakoodin) käyttämällä universaaleja alukkeita, sitten sekvensoi miljoonia DNA-fragmentteja. Lukemat klusteroidaan operationaalisiksi taksonomisiksi yksiköiksi (OTU) tai amplikonisekvenssivarianteiksi (ASV) ja verrataan referenssitietokantoihin lajien tunnistamiseksi.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Lähteet
- Taberlet, P., Coissac, E., Hajibabaei, M., & Rieseberg, L. H. (2012). Environmental DNA. Molecular Ecology, 21(8), 1789-1793. DOI: 10.1111/j.1365-294X.2012.05542.x ↗
- Deakin, G., Pettitt-Wade, H., & Waldick, R. C. (2016). Environmental DNA metabarcoding: A review of the application to fish biodiversity assessment in temperate freshwaters. Environmental DNA, 1(1), 4-14. link ↗
- Ficetola, G. F., Miaud, C., Pompanon, F., & Taberlet, P. (2008). Species detection using environmental DNA from water samples. Biology Letters, 4(4), 423-425. DOI: 10.1098/rsbl.2008.0118 ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Environmental DNA Metabarcoding. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/ecology/edna-metabarcoding
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- BioakkumulaatiomalliEkologia↔ compare
- EtäisyysotantaEkologia↔ compare
- Funktionaalinen diversiteettiEkologia↔ compare
- Lajien kumulatiivinen kertymäkäyräEkologia↔ compare
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →