ردهبندیهای آرایهشناختی و سلسلهمراتب
سلسلهمراتب لینه، آرایهها را در ردههای تودرتو، از حوزه و فرمانرو تا گونه، سازماندهی میکند و سیستم آدرسدهی مورد استفاده در سراسر زیستشناسی را فراهم میآورد.
Definition
رده آرایهشناختی یک موقعیت نسبی در سلسلهمراتب طبقهبندی تودرتو است؛ سلسلهمراتب مجموعه مرتبی از چنین ردههایی است که آرایهها در آن قرار میگیرند و تحت کد نامگذاری مربوطه نامگذاری میشوند.
Scope
این موضوع ردههای استاندارد (حوزه، فرمانرو، شاخه، رده، راسته، خانواده، سرده، گونه) و زیربخشهای آنها، معنا و محدودیتهای ردهها، تنش بین ردههای ثابت و یک درخت شاخهبندی پیوسته، و معرفی رده حوزه به دنبال شواهد مولکولی برای سه تبار اصلی حیات را پوشش میدهد.
Core questions
- ردههای اصلی لینه کدامند و چگونه در یکدیگر جای میگیرند؟
- آیا ردهها از نظر زیستی در گروههای مختلف قابل مقایسه هستند؟
- چگونه مجموعهای ثابت از ردهها ساختار پیوسته یک درخت فیلوژنتیک را در خود جای میدهد؟
- چرا حوزه در طبقهبندیهای مدرن بالاتر از فرمانرو اضافه شد؟
Key theories
- سیستم سهحوزهای
- مقایسه توالیهای RNA ریبوزومی سه تبار اصلی، باکتریها، آرکئا، و یوکاریا را آشکار کرد که منجر به پیشنهاد حوزه به عنوان بالاترین رده بالاتر از فرمانرو شد.
- خودسرانه بودن ردهها
- ردههای بالاتر از گونه نشاندهنده تودرتویی نسبی هستند اما هیچ همارزی زیستی جهانی ندارند، بنابراین یک خانواده در حشرات با یک خانواده در پستانداران قابل مقایسه نیست؛ این امر مقایسههای مبتنی بر رده را محدود میکند.
Clinical relevance
نامهای ردهبندی شده کلیدهای شاخص پایگاههای داده زیستی، فهرستهای نظارتی، و میکروبیولوژی بالینی هستند، بنابراین تغییرات در رده یا جایگاه از طریق تشخیصها، دارونامهها، و کنترلهای امنیت زیستی تأثیرگذار است.
History
سلسلهمراتب ردهبندی شده از Systema Naturae لینه در قرن هجدهم نشأت میگیرد و مدتها در سطح فرمانرو محدود بود؛ فیلوژنتیک مولکولی در اواخر قرن بیستم با پیشنهاد سه حوزه، بالای سلسلهمراتب را بازسازی کرد و بحث در مورد اینکه آیا ردههای مطلق باید اصلاً حفظ شوند را دوباره زنده کرد.
Debates
- آیا ردههای مطلق باید کنار گذاشته شوند
- طرفداران نامگذاری فیلوژنتیک بدون رده استدلال میکنند که ردههای ثابت لینه همارزی کاذب را بر یک درخت پیوسته تحمیل میکنند، در حالی که مدافعان ردهها را برای ثبات، ارتباطات، و ساختار پایگاه داده ارزشمند میدانند.
Key figures
- Carl Linnaeus
- Ernst Mayr
- Carl Woese
Related topics
Seminal works
- mayr1969
- woese1990
- schuh2009
Frequently asked questions
- آیا یک 'خانواده' در پرندگان معادل یک 'خانواده' در گیاهان است؟
- خیر. ردههای بالاتر از گونه موقعیت نسبی در سلسلهمراتب را نشان میدهند اما هیچ معنای زیستی جهانی ندارند، بنابراین آرایههای همرده در گروههای مختلف از نظر سن، تنوع یا تمایز قابل مقایسه نیستند.
- بالاترین رده آرایهشناختی چیست؟
- در سیستم سهحوزهای که به طور گسترده استفاده میشود، بالاترین رده، حوزه است که شامل باکتریها، آرکئا و یوکاریا میشود و بالاتر از فرمانرو قرار میگیرد.