زیگومیست‌ها و سایر شاخه‌های قارچی

زیگومیست‌ها یک گروه تاریخی از قارچ‌های رشته‌ای با رشد سریع هستند که به طور سنتی با تشکیل یک هاگ جنسی با دیواره ضخیم به نام زیگوسپور تعریف می‌شوند. فیلوژنتیک مولکولی نشان داده است که شاخه قدیمی «زیگومیکوتا» یک تبار طبیعی واحد نیست و اعضای آن به شاخه موکورومیکوتا و چندین شاخه مرتبط دیگر، در کنار سایر شاخه‌های اولیه منشعب شده از سلسله قارچ‌ها، اختصاص داده شده‌اند.

Definition

زیگومیست‌ها قارچ‌های رشته‌ای هم‌سفره‌ای (عمدتاً بدون دیواره عرضی) هستند که از نظر تاریخی بر اساس تولید زیگوسپورهایشان گروه‌بندی شده‌اند؛ این گروه‌بندی اکنون به عنوان غیر تک‌تبار شناخته می‌شود و اعضای آن عمدتاً در میان موکورومیکوتا و شاخه‌های اولیه منشعب شده مرتبط، به جای یک شاخه واحد زیگومیکوتا، توزیع شده‌اند.

Scope

این موضوع به قارچ‌های زیگومیست و سایر شاخه‌های غیر دیکاریا از سلسله قارچ‌ها می‌پردازد. این مقاله زیگوسپور را به عنوان ویژگی تعریف‌کننده تاریخی، دلایل تجزیه این گروه توسط فیلوژنتیک در مقیاس ژنوم، و موقعیت تبارهای اولیه منشعب شده مرتبط را توضیح می‌دهد. راسته موکورالیس که از نظر بالینی قابل توجه است، به عنوان لنگر اصلی MeSH مورد بررسی قرار می‌گیرد. این مدخل یک مرور کلی مرجع است و هیچ راهنمایی تشخیصی یا درمانی ارائه نمی‌دهد.

Core questions

• زیگوسپور چیست و چرا زیگومیست‌های تاریخی را تعریف می‌کرد؟
• چرا شاخه «زیگومیکوتا» به عنوان یک گروه طبیعی کنار گذاشته شد؟
• زیگومیست‌های سابق امروزه چگونه در میان موکورومیکوتا و شاخه‌های مرتبط توزیع شده‌اند؟
• شاخه‌های اولیه منشعب شده قارچی چه تفاوتی با دیکاریا دارند؟

Key concepts

• زیگوسپور
• ریسه‌های هم‌سفره‌ای (عمدتاً بدون دیواره عرضی)
• اسپورانژیا و اسپورانژیوسپورها
• راسته موکورالیس
• شاخه موکورومیکوتا
• غیر تک‌تباری «زیگومیکوتا»
• تبارهای قارچی اولیه منشعب شده (پایه‌ای)
• ریسه‌های پهن، نواری‌شکل و بدون دیواره عرضی در بافت

Mechanisms

زیگومیست‌های کلاسیک هنگامی که دو ریسه سازگار با هم ترکیب می‌شوند، یک زیگوسپور تشکیل می‌دهند و معمولاً به صورت غیرجنسی توسط اسپورانژیوسپورهایی که در داخل یک اسپورانژیوم تولید می‌شوند، تولید مثل می‌کنند؛ ریسه‌های آن‌ها پهن و عمدتاً بدون دیواره عرضی (هم‌سفره‌ای) هستند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک در مقیاس ژنوم نشان داد که تاکسون‌هایی که این ویژگی‌ها را به اشتراک می‌گذارند، یک کلاد واحد را تشکیل نمی‌دهند، که منجر به طبقه‌بندی مجدد آن‌ها به شاخه موکورومیکوتا و چندین شاخه مرتبط دیگر به جای یک شاخه زیگومیکوتا شد (Spatafora و همکاران، 2016)، که طرح سطح بالاتر قبلی Hibbett و همکاران (2007) را اصلاح کرد. ریسه‌های پهن و کم‌دیواره این قارچ‌ها به آن‌ها ظاهری متمایز در مقاطع بافتی می‌دهد (Guarner & Brandt, 2011).

Clinical relevance

اعضای راسته موکورالیس عامل موکورمایکوزیس هستند، یک عفونت مهاجم که زیست‌شناسی آن به توضیح دشواری مدیریت آن کمک می‌کند (Katragkou و همکاران، 2014)، و ریسه‌های مشخصه پهن، نواری‌شکل و کم‌دیواره آن به تشخیص آن در هیستوپاتولوژی کمک می‌کند (Guarner & Brandt, 2011). این مدخل طبقه‌بندی و مورفولوژی را که این قارچ‌ها را قابل شناسایی می‌کند، توصیف می‌کند و منبعی برای توصیه‌های تشخیصی یا درمانی فردی نیست.

Evidence & guidelines

طبقه‌بندی فعلی زیگومیست‌های سابق از بازنگری در سطح شاخه در مقیاس ژنوم توسط Spatafora و همکاران (2016) پیروی می‌کند، که در برابر طرح قبلی در سطح کل سلسله توسط Hibbett و همکاران (2007) قرار می‌گیرد. زمینه بالینی و هیستوپاتولوژیک برای موکورالیس از Guarner و Brandt (2011) و Katragkou و همکاران (2014) گرفته شده است.

History

برای بیشتر قرن بیستم، شاخه زیگومیکوتا قارچ‌هایی را که زیگوسپور تولید می‌کردند، با موکورالیس به عنوان شناخته‌شده‌ترین راسته آن، متحد می‌کرد. با انباشته شدن فیلوژنی‌های مبتنی بر DNA، این گروه به عنوان یک مجموعه مصنوعی از چندین تبار متمایز ثابت شد؛ طبقه‌بندی سطح بالاتر Hibbett و همکاران (2007) قبلاً این بی‌ثباتی را نشان داده بود، و تجزیه و تحلیل در مقیاس ژنوم Spatafora و همکاران (2016) رسماً «زیگومیکوتا» را با موکورومیکوتا و شاخه‌های مرتبط جایگزین کرد.

Debates

آیا «زیگومیکوتا» یک شاخه معتبر است؟

فیلوژنتیک در مقیاس ژنوم نشان می‌دهد که قارچ‌های تشکیل‌دهنده زیگوسپور یک جد مشترک واحد را به استثنای دیگران به اشتراک نمی‌گذارند، بنابراین این شاخه منحل شد و اعضای آن به موکورومیکوتا و شاخه‌های مرتبط اختصاص داده شدند؛ نام قدیمی به طور غیررسمی باقی مانده است.

Key figures

• Joseph W. Spatafora
• Gerald L. Benny
• David Hibbett
• Jason E. Stajich

Seminal works

• spatafora-2016
• hibbett-2007

Frequently asked questions

آیا «زیگومیکوتا» هنوز یک شاخه شناخته شده است؟

خیر. مطالعات در مقیاس ژنوم نشان داد که این یک تبار طبیعی واحد نیست و اعضای آن عمدتاً به شاخه موکورومیکوتا و چندین شاخه اولیه منشعب شده مرتبط اختصاص داده شده‌اند، اگرچه اصطلاح زیگومیست‌ها به طور غیررسمی استفاده می‌شود.

چه چیزی ریسه‌های زیگومیست را متمایز می‌کند؟

آن‌ها معمولاً پهن و هم‌سفره‌ای هستند، به این معنی که دیواره عرضی (سپتا) کمی دارند یا اصلاً ندارند، که به آن‌ها ظاهری مشخصه پهن و نواری‌شکل در مقایسه با ریسه‌های دارای دیواره عرضی منظم دیکاریا می‌دهد.