مونتاژ دی نوو ترانسکریپتوم
مونتاژ دی نوو ترانسکریپتوم، توالیهای کامل RNA پیامرسان را مستقیماً از خوانشهای توالییابی بدون نیاز به ژنوم مرجع بازسازی میکند. این پایپلاین که توسط رگف، هاس و همکارانشان پیشگام شد، امکان کشف ترانسکریپت در ارگانیسمهای غیرمدل و تشخیص ایزوفرمهای جدید، ژنهای همجوشی و واریانتهای اسپلایس را فراهم میکند.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
نقشهٔ روش
همسایگی روشهای مرتبط — برای کاوش، یک گره را برگزینید.
منابع
- Grabherr, M. G., Haas, B. J., Yassour, M., Levin, J. Z., Thompson, D. A., Amit, I., ... & Regev, A. (2011). Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome. Nature Biotechnology, 29(7), 644-652. DOI: 10.1038/nbt.1883 ↗
- Haas, B. J., Papanicolaou, A., Yassour, M., Grabherr, M., Blood, P. D., Bowden, J., ... & Regev, A. (2013). De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis. Nature Protocols, 8(8), 1494-1512. DOI: 10.1038/nprot.2013.084 ↗
- Pertea, M., Pertea, G. M., Antonescu, C. M., Chang, T. C., Mendell, J. T., & Salzberg, S. L. (2015). StringTie enables improved assembly of novel transcripts from RNA-seq data. Nature Biotechnology, 33(3), 290-295. link ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). De Novo RNA-Seq Transcriptome Assembly. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/de-novo-transcriptome-assembly
کدام روش؟
این روش را در کنار نزدیکترین روشهای خویشاوندش بگذارید و آنها را کنار هم بخوانید — کتابخانه کتابها را روی میز میگشاید؛ انتخاب با شماست.
- تحلیل غربالگری CRISPRزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- جستجوی پروفایل HMMERزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- بندیسازی متاژنومیزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →