جستجوی پروفایل HMMER
جستجوی پروفایل HMMER با استفاده از مدلهای احتمالی خانوادههای پروتئینی، موسوم به مدلهای پنهان مارکوف پروفایلی (HMMs)، همولوگهای توالی پروتئینی دوردست را شناسایی میکند. این روش که توسط ادی و همکارانش توسعه یافته است، الگوهای تنوع توالی را در خانوادههای پروتئینی ثبت کرده و همولوگها را با حساسیت بسیار بیشتری نسبت به ماتریسهای وزن موقعیت یا همترازی دوتایی تشخیص میدهد.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
نقشهٔ روش
همسایگی روشهای مرتبط — برای کاوش، یک گره را برگزینید.
منابع
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/hmmer-profile-search
کدام روش؟
این روش را در کنار نزدیکترین روشهای خویشاوندش بگذارید و آنها را کنار هم بخوانید — کتابخانه کتابها را روی میز میگشاید؛ انتخاب با شماست.
- بازسازی با میکروسکوپ الکترونی کرایوژنیک (Cryo-EM)زیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- بندیسازی متاژنومیزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- لنگراندازی مولکولیزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →