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Time-series single-cell RNA-seq analysis/Evidenz
Nachweisdatensatz der Methode

Time-series single-cell RNA-seq analysis

Time-series single-cell RNA-seq analysis captures gene expression across multiple time points at single-cell resolution to reveal how cell populations emerge, transition, and diverge during dynamic biological processes such as development, differentiation, or disease progression. By combining pseudotime ordering, RNA velocity, and differential dynamics testing, researchers reconstruct the temporal trajectory of individual cells and identify the gene regulatory changes that drive biological transitions.

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Quellendatensatz

Zitate wörtlich aus dem Quellendatensatz der Methode übernommen. Daraus wird keine Überprüfung auf Claim-Ebene abgeleitet.

Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis
Taxonomischer Methodendatensatz · process-pipeline / bioinformatics
  • Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. · DOI 10.1038/nbt.2859
  • La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. · DOI 10.1038/s41586-018-0414-6
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Evidenzstatus

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Quellen

2 aufgezeichnete Zitate, kopiert aus dem Quellendatensatz der Methode.

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