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Machine learning-assisted expression quantitative trait loci analysis/Evidenz
Nachweisdatensatz der Methode

Machine learning-assisted expression quantitative trait loci analysis

Machine learning-assisted eQTL analysis integrates supervised learning models — ranging from elastic-net regression to deep neural networks — into the classical eQTL framework to predict and map genetic variants that regulate gene expression. By training predictive models on reference panels (e.g., GTEx), the approach enables imputation of gene expression in cohorts lacking RNA data, substantially increasing statistical power and enabling trans-tissue generalisation.

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Quellendatensatz

Zitate wörtlich aus dem Quellendatensatz der Methode übernommen. Daraus wird keine Überprüfung auf Claim-Ebene abgeleitet.

Machine Learning-Assisted Expression Quantitative Trait Loci Analysis
Taxonomischer Methodendatensatz · process-pipeline / bioinformatics
  • Gamazon, E. R., Wheeler, H. E., Shah, K. P., Mozaffari, S. V., Aquino-Michaels, K., Carroll, R. J., ... & Im, H. K. (2015). A gene-based association method for mapping traits using reference transcriptome data. Nature Genetics, 47(9), 1091-1098. · URL
  • Zhou, J., & Troyanskaya, O. G. (2015). Predicting effects of noncoding variants with deep learning-based sequence model. Nature Methods, 12(10), 931-934. · URL
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Evidenzstatus

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Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Quellen

2 aufgezeichnete Zitate, kopiert aus dem Quellendatensatz der Methode.

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