Analyse af mikrobiel diversitet på enkeltcelle-niveau
Analyse af mikrobiel diversitet på enkeltcelle-niveau opløser sammensætningen og den funktionelle heterogenitet af mikrobielle samfund på niveauet af individuelle celler eller bakterier. Ved at kombinere isolering af enkeltceller eller enkeltbakterier med high-throughput sekventering, overvinder denne pipeline middelværdieffekten af bulk-metagenomik, hvilket muliggør detektion af sjældne stammer, intra-artsvariation og celle-til-celle-heterogenitet inden for komplekse mikrobiomer såsom tarm-, mundhule- eller miljøprøver.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Kehe, J., Kulesa, A., Ortiz, A., Ackerman, C. M., Thakku, S. G., Sellers, D., Bhatt, S., ... & Blainey, P. C. (2019). Massively parallel screening of synthetic microbial communities. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(26), 12804-12809. link ↗
- Zheng, W., Zhao, S., Yin, Y., Zhang, H., Needham, D. M., Evans, E. D., Bhatt, S., ... & Bhatt, D. L. (2020). High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science, 376(6597), eabm1483. link ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Resolution Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/single-cell-microbiome-diversity-analysis
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- Multi-omics Mikrobiom DiversitetsanalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell RNA-seq AnalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell variant callingBioinformatik↔ sammenlign
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →