Netværksbaseret fylogenetisk analyse — Inferens af fylogenetiske netværk

Netværksbaseret fylogenetisk analyse konstruerer grafstrukturerede repræsentationer af evolutionære relationer, der eksplicit imødekommer retikulære begivenheder — herunder hybridisering, horisontal genoverførsel, rekombination og ufuldstændig linjesortering — som strengt bifurkerende fylogenetiske træer ikke kan repræsentere. I stedet for at tvinge sekvenser ind i et enkelt bifurkerende træ, infererer metoden splits eller retikulationer i dataene og visualiserer dem som et netværk, der afslører modstridende fylogenetiske signaler, som er biologisk informative.