تمثيل المعرفة والأنطولوجيات السريرية
تمثيل المعرفة هو جزء من المعلوماتية السريرية يهتم بترميز المعنى الطبي في شكل يمكن لأجهزة الكمبيوتر تخزينه ومشاركته والاستدلال عليه. توفر المصطلحات والأنطولوجيات المنضبطة المفردات الرسمية والمفاهيم والعلاقات التي تتيح للبيانات السريرية ومنطق دعم القرار الإشارة إلى نفس الأشياء بشكل لا لبس فيه، مما يدعم قابلية التشغيل البيني والاستدلال الآلي.
Definition
في المعلوماتية السريرية، تمثيل المعرفة هو استخدام هياكل رسمية، مثل المفردات والأنطولوجيات المنضبطة، لالتقاط المفاهيم والعلاقات فيما بينها بحيث يمكن للبرمجيات معالجة المعنى السريري؛ الأنطولوجيا هي مواصفات صريحة ورسمية لتصور مشترك لمجال معين.
Scope
يغطي هذا المدخل المفردات والمصطلحات والأنطولوجيات المنضبطة المستخدمة في الرعاية الصحية؛ والفرق بين قائمة رموز بسيطة وأنطولوجيا منطق وصفي ذات مفاهيم وعلاقات محددة؛ والموارد الرئيسية مثل SNOMED CT، و UMLS Metathesaurus، و LOINC؛ ودور هذه المصنوعات في قابلية التشغيل البيني ودعم القرار. إنه موضوع منهجي وبنيوي، يصف كيفية هيكلة المعرفة السريرية بدلاً من تقديم توصيات سريرية.
Key concepts
- المفردات والمصطلحات المنضبطة
- الأنطولوجيا والتسلسل الهرمي للمفاهيم
- منطق الوصف والدلالات الرسمية
- SNOMED CT، LOINC، و RxNorm
- نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS) Metathesaurus
- قابلية التشغيل البيني الدلالي
- ربط المفاهيم وربط المصطلحات
- التنسيق اللاحق والتعبير التركيبي
Mechanisms
تُسند المصطلحات مُعرّفات مستقرة للمفاهيم السريرية وترتبها في تسلسلات هرمية؛ وتضيف الأنطولوجيات علاقات مُعرّفة رسميًا (مثل is-a و part-of) تدعم التصنيف والاستدلال الآلي. تربط الموارد المتكاملة مثل UMLS العديد من المفردات المصدرية من خلال Metathesaurus وشبكة دلالية مشتركة، بحيث يمكن حل المرادفات والتكافؤات عبر المفردات (Bodenreider, 2004). أوضحت أنطولوجيا الجينات، في البيولوجيا الجزيئية، كيف يمكن لمفردات منظمة مشتركة توحيد التعليقات التوضيحية عبر قواعد البيانات، وهو نموذج أثر على ممارسة الأنطولوجيا الطبية الحيوية على نطاق واسع (Ashburner, 2000). ثم تتيح الواجهات القائمة على المعايير للبيانات المشفرة ومنطق القرار التفاعل عبر الأنظمة (Mandel, 2016).
Clinical relevance
تُشكل المصطلحات المشفرة أساس قوائم المشكلات، ونتائج المختبرات، وسجلات الأدوية، والقواعد التي تقيّمها أنظمة دعم القرار، لذا فإن جودة تمثيل المعرفة تؤثر على ما إذا كان يمكن تجميع البيانات وتبادلها والعمل عليها بشكل موثوق. يصف هذا المدخل الهياكل الكامنة وراء البيانات السريرية المشفرة؛ ولا يحدد المعنى السريري لأي حالة فردية أو يقدم إرشادات علاجية.
Evidence & guidelines
يُعد تمثيل المعرفة إلى حد كبير مسألة معايير وبنية تحتية بدلاً من تجارب النتائج السريرية. تُوصف الموارد الأساسية في منشوراتها الأولية: UMLS كطبقة تكاملية فوق العديد من المفردات (Bodenreider, 2004) وأنطولوجيا الجينات كمفردات منظمة موحدة (Ashburner, 2000). تحدد معايير قابلية التشغيل البيني مثل SMART on FHIR كيفية تبادل البيانات المشفرة والتطبيقات للمعلومات عبر المنصات (Mandel, 2016).
History
تعود المفردات الطبية المنضبطة إلى عقود مضت، من التسميات المبكرة إلى MeSH وتطوير SNOMED. شهدت التسعينيات دمج UMLS للمفردات المتباينة، وحوالي عام 2000، أدخلت الأنطولوجيات الرسمية، التي تجسدت في أنطولوجيا الجينات، دلالات منطق الوصف إلى المعرفة الطبية الحيوية. ركزت أعمال المعايير اللاحقة على قابلية التشغيل البيني بحيث يمكن للمعرفة المشفرة الانتقال عبر المؤسسات والأنظمة.
Debates
- ما مدى تعبيرية المصطلحات السريرية؟
- تُسجل الأنطولوجيات عالية التعبيرية والمُنسقة لاحقًا الفروق الدقيقة ولكن يصعب تأليفها وصيانتها واستخدامها باستمرار، بينما قوائم الرموز المُعدّدة الأبسط أسهل في التطبيق ولكنها تفقد المعنى؛ ولا يزال التوازن بين التعبيرية وسهولة الاستخدام محل جدل.
Key figures
- Olivier Bodenreider
- Mark A. Musen
- Christopher G. Chute
- Michael Ashburner
Related topics
Seminal works
- bodenreider-2004
- ashburner-2000
Frequently asked questions
- ما الفرق بين المصطلحات والأنطولوجيا؟
- المصطلحات هي في الأساس قائمة منضبطة من المفاهيم المسماة، غالبًا ما تكون مرتبة هرميًا، بينما تضيف الأنطولوجيا علاقات محددة رسميًا ودلالات منطقية تسمح للبرمجيات بتصنيف المفاهيم والاستدلال عليها تلقائيًا.
- لماذا تعتبر الأنطولوجيات السريرية مهمة لدعم القرار؟
- يجب أن تشير قواعد دعم القرار وبيانات المريض إلى نفس المفاهيم للتفاعل؛ وتوفر الأنطولوجيات والمصطلحات المشتركة لهم مفردات مشتركة قابلة للقراءة آليًا، وهو شرط أساسي للدعم المحمول والموثوق.