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Single-cell Microbiome Diversity Analysis/证据
方法证据记录

Single-cell Microbiome Diversity Analysis

Single-cell microbiome diversity analysis resolves the composition and functional heterogeneity of microbial communities at the level of individual cells or bacteria. By combining single-cell or single-bacterium isolation with high-throughput sequencing, this pipeline overcomes the averaging effect of bulk metagenomics, enabling detection of rare strains, intra-species variation, and cell-to-cell heterogeneity within complex microbiomes such as the gut, oral cavity, or environmental samples.

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源记录

引文逐字复制自方法源记录。这些引文不代表任何层级的验证。

Single-cell Resolution Microbiome Diversity Analysis
分类方法记录 · process-pipeline / bioinformatics
  • Kehe, J., Kulesa, A., Ortiz, A., Ackerman, C. M., Thakku, S. G., Sellers, D., Bhatt, S., ... & Blainey, P. C. (2019). Massively parallel screening of synthetic microbial communities. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(26), 12804-12809. · URL
  • Zheng, W., Zhao, S., Yin, Y., Zhang, H., Needham, D. M., Evans, E. D., Bhatt, S., ... & Bhatt, D. L. (2020). High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science, 376(6597), eabm1483. · URL
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Taxonomic bucketMulti-omics microbiome diversity analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell variant callingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

证据状态

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来源

从方法源记录复制的 2 条记录的引文。

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