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基于网络的单细胞RNA测序分析
基于网络的单细胞RNA测序分析通过从单细胞转录组数据构建和探究分子相互作用网络（基因调控网络、共表达网络或细胞间通讯图）来扩展标准的scRNA-seq工作流程。该方法不将每个基因视为独立个体，而是捕捉细胞内和细胞间种群中基因回路和细胞间信号通路协调的活动，从而在单细胞分辨率下实现系统层面的转录调控视图。
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来源
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
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