Phân loại và Phân loại Ký sinh trùng
Phân loại và phân loại ký sinh trùng là một nhánh của ký sinh trùng học chuyên đặt tên, mô tả và sắp xếp các sinh vật nhân chuẩn và động vật chân đốt sống ký sinh trên vật chủ. Ngành này nhóm các ký sinh trùng có tầm quan trọng y tế và thú y thành ba nhóm lớn được sử dụng trong giảng dạy lâm sàng – động vật nguyên sinh, giun sán (giun) và động vật chân đốt – đồng thời điều hòa cách phân nhóm truyền thống, dựa trên hình thái học đó với phân loại tiến hóa chính thức của sinh vật nhân chuẩn.
Definition
Phân loại và phân loại ký sinh trùng là việc đặt tên, mô tả và phân nhóm theo thứ bậc một cách có hệ thống các sinh vật ký sinh – chủ yếu là động vật nguyên sinh, giun sán, và động vật chân đốt ký sinh hoặc vật trung gian truyền bệnh – dựa trên hình thái học, chu trình sống, và ngày càng nhiều là phát sinh loài phân tử.
Scope
Lĩnh vực này định hướng cho người đọc về cách ký sinh trùng được phân loại: sơ đồ hình thái học lịch sử của động vật nguyên sinh đơn bào, giun sán đa bào, và ký sinh trùng và vật trung gian truyền bệnh chân đốt; khuôn khổ phân tử hiện đại đặt các sinh vật này vào cây sinh vật nhân chuẩn; và các quy ước đặt tên và nhận dạng thực tế làm nền tảng cho chẩn đoán, giám sát và phần còn lại của ký sinh trùng học. Đây là một tổng quan tham khảo và giáo dục về phân loại, không phải là một sổ tay lâm sàng hoặc chẩn đoán.
Sub-topics
Core questions
- Các ký sinh trùng quan trọng về mặt y tế được nhóm thành động vật nguyên sinh, giun sán và động vật chân đốt như thế nào, và tại sao cách phân nhóm đó lại mang tính thực tiễn hơn là thuần túy phát sinh loài?
- Phân loại phân tử chính thức của sinh vật nhân chuẩn tổ chức lại các loại ký sinh trùng truyền thống như thế nào?
- Những đặc điểm hình thái và chu trình sống nào được sử dụng để nhận dạng và phân biệt các nhóm ký sinh trùng?
- Các quy ước đặt tên và hệ thống học hỗ trợ chẩn đoán, giám sát và giao tiếp trong ký sinh trùng học như thế nào?
Key concepts
- Động vật nguyên sinh, giun sán và động vật chân đốt là ba nhóm giảng dạy
- Phân loại hình thái học so với phân loại phân tử (phát sinh loài)
- Các siêu nhóm sinh vật nhân chuẩn và cây sự sống
- Chu trình sống như một đặc điểm phân loại và chẩn đoán
- Tính đặc hiệu vật chủ-ký sinh trùng và đồng tiến hóa
- Danh pháp hai phần và hệ thống học
- Vật chủ xác định so với vật chủ trung gian
Mechanisms
Việc phân loại được tiến hành bằng cách so sánh các sinh vật dựa trên hình thái học, các giai đoạn chu trình sống, phạm vi vật chủ, và – trong thực hành hiện đại – dữ liệu trình tự phân tử. Trong lịch sử, ký sinh trùng được phân loại theo cấu trúc có thể nhìn thấy và sinh học sinh sản thành động vật nguyên sinh đơn bào, giun sán đa bào và động vật chân đốt có khớp. Phát sinh loài phân tử sau đó đã đặt các sinh vật này vào phân loại chính thức của sinh vật nhân chuẩn, cho thấy rằng các loại tiện lợi về mặt lâm sàng cắt ngang các siêu nhóm sinh vật nhân chuẩn thay vì hình thành các đơn vị tiến hóa tự nhiên. Ví dụ, giun tròn đã được tổ chức thành các nhánh bằng cách sử dụng dữ liệu trình tự ribosome, tinh chỉnh một khuôn khổ từng chỉ dựa trên hình thái học. Do đó, bộ ba giảng dạy vẫn hữu ích cho chẩn đoán và giao tiếp trong khi được diễn giải dựa trên một xương sống tiến hóa.
Clinical relevance
Phân loại chính xác là nền tảng cho việc nhận dạng ký sinh trùng trong môi trường lâm sàng và phòng thí nghiệm, tên gọi được sử dụng trong giám sát và báo cáo, và việc tổ chức kiến thức trong toàn bộ ký sinh trùng học. Lĩnh vực này mô tả cách ký sinh trùng được phân loại và nhận dạng thay vì đưa ra các giao thức chẩn đoán hoặc điều trị; các thực thể lâm sàng cụ thể và cách quản lý chúng được đề cập trong các chủ đề chuyên biệt khác trong atlas.
Evidence & guidelines
Việc phân nhóm ký sinh trùng dựa trên các văn bản ký sinh trùng học chẩn đoán tham khảo và trên phân loại sinh vật nhân chuẩn đồng thuận được duy trì bởi Hiệp hội các nhà nghiên cứu sinh vật nguyên sinh quốc tế (International Society of Protistologists), được sửa đổi gần đây nhất bởi Adl và cộng sự (2019). Các khuôn khổ phân tử như phát sinh loài giun tròn của Blaxter và cộng sự (1998) cung cấp thông tin về cách các nhóm truyền thống ánh xạ vào các dòng dõi tiến hóa.
History
Ký sinh trùng học ban đầu phân loại các sinh vật dựa trên những gì có thể nhìn thấy dưới kính hiển vi và cấu trúc của giun và động vật chân đốt, tạo ra sự phân chia bền vững thành động vật nguyên sinh, giun sán và động vật chân đốt. Trong suốt thế kỷ XX, phạm vi vật chủ, chu trình sống và cấu trúc siêu vi đã tinh chỉnh các nhóm này. Từ cuối thế kỷ XX trở đi, dữ liệu phân tử đã tổ chức lại các sinh vật nhân chuẩn thành các siêu nhóm, và công trình của Anderson và May về đồng tiến hóa vật chủ-ký sinh trùng đã định hình ký sinh trùng như một phần của động lực tiến hóa và sinh thái rộng lớn hơn. Các phân loại sinh vật nhân chuẩn đồng thuận, được cộng đồng nghiên cứu sinh vật nguyên sinh định kỳ sửa đổi, hiện cung cấp giàn giáo tiến hóa mà trên đó phân loại ký sinh trùng y học được diễn giải.
Debates
- Các nhóm giảng dạy truyền thống so với phân loại phát sinh loài
- Bộ ba lâm sàng gồm động vật nguyên sinh, giun sán và động vật chân đốt mang tính thực tiễn cho chẩn đoán nhưng không tương ứng với các nhóm tiến hóa tự nhiên; việc điều hòa sự tiện lợi về mặt sư phạm với hệ thống học phân tử là một sự căng thẳng đang diễn ra trong cách trình bày và đặt tên ký sinh trùng.
Key figures
- Sina Adl
- Mark Blaxter
- Roy Anderson
- Robert May
- Lynne Garcia
Related topics
Seminal works
- adl-2019
- blaxter-1998
- anderson-1982
Frequently asked questions
- Các nhóm ký sinh trùng chính là gì?
- Các ký sinh trùng quan trọng về mặt y tế theo truyền thống được nhóm thành động vật nguyên sinh (đơn bào), giun sán (giun đa bào) và động vật chân đốt (như ve, mạt và côn trùng hoạt động như ký sinh trùng hoặc vật trung gian truyền bệnh). Cách phân nhóm này mang tính thực tiễn cho việc giảng dạy và chẩn đoán hơn là một phân loại tiến hóa nghiêm ngặt.
- Tại sao phân loại ký sinh trùng liên tục thay đổi?
- Dữ liệu trình tự phân tử tiếp tục tiết lộ các mối quan hệ tiến hóa mà chỉ hình thái học không thể cho thấy, vì vậy phân loại chính thức của sinh vật nhân chuẩn – và vị trí của các nhóm ký sinh trùng trong đó – được cộng đồng hệ thống học định kỳ sửa đổi.