Phân tích phát sinh loài dựa trên mạng lưới — Suy luận mạng lưới phát sinh loài

Phân tích phát sinh loài dựa trên mạng lưới xây dựng các biểu diễn cấu trúc đồ thị về mối quan hệ tiến hóa, vốn bao hàm rõ ràng các sự kiện mạng lưới — bao gồm lai ghép, chuyển gen ngang, tái tổ hợp và phân kỳ dòng dõi không hoàn chỉnh — mà cây phát sinh loài phân nhánh nghiêm ngặt không thể biểu diễn. Thay vì ép các chuỗi vào một cây phân nhánh duy nhất, phương pháp này suy luận các điểm rẽ hoặc mạng lưới trong dữ liệu và hình dung chúng dưới dạng một mạng lưới, làm lộ ra các tín hiệu phát sinh loài mâu thuẫn có ý nghĩa sinh học.