Zigomiçetler ve Diğer Fungal Bölümler
Zigomiçetler, geleneksel olarak zigospore adı verilen kalın duvarlı bir eşeyli sporun oluşumuyla tanımlanan, hızlı büyüyen, çoğunlukla ipliksi mantarların tarihsel bir grubudur. Moleküler filogenetik çalışmalar, eski 'Zygomycota' filumunun tek bir doğal soy olmadığını göstermiş ve üyeleri, mantar aleminin diğer erken ayrılan bölümleriyle birlikte Mucoromycota filumuna ve birkaç müttefik filuma yeniden atanmıştır.
Tanım
Zigomiçetler, tarihsel olarak zigospore üretmeleriyle gruplandırılan senositik (büyük ölçüde septasız) ipliksi mantarlardır; bu gruplandırma artık monofiletik olmadığı kabul edilmekte olup, üyeleri tek bir Zygomycota filumu yerine esas olarak Mucoromycota ve müttefik erken ayrılan filumlar arasında dağılmıştır.
Kapsam
Bu konu, zigomiçet mantarlarını ve Fungi aleminin Dikarya dışındaki diğer bölümlerini kapsamaktadır. Zigospore'un tarihsel tanımlayıcı özelliği, grubun genom ölçekli filogenetik ile neden ayrıldığı ve ilgili erken ayrılan soyların konumu açıklanmaktadır. Klinik olarak önemli olan Mucorales takımı, başlıca MeSH çapası olarak ele alınmaktadır. Bu giriş, bir referans genel bakış niteliğindedir ve tanı veya tedavi rehberliği sunmamaktadır.
Temel sorular
- Zigospore nedir ve tarihsel zigomiçetleri neden tanımlamıştır?
- 'Zygomycota' filumu neden doğal bir grup olarak terk edilmiştir?
- Eski zigomiçetler günümüzde Mucoromycota ve müttefik filumlar arasında nasıl dağılmıştır?
- Erken ayrılan fungal bölümler Dikarya'dan nasıl farklılık göstermektedir?
Anahtar kavramlar
- Zigospore
- Senositik (büyük ölçüde septasız) hifler
- Sporangia ve sporangiosporlar
- Mucorales takımı
- Mucoromycota filumu
- 'Zygomycota'nın monofiletik olmaması
- Erken ayrılan (bazal) fungal soylar
- Dokuda geniş, kurdele benzeri septasız hifler
Mekanizmalar
Klasik zigomiçetler, iki uyumlu hif birleştiğinde bir zigospore oluşturur ve tipik olarak bir sporangium içinde üretilen sporangiosporlar aracılığıyla eşeysiz olarak çoğalırlar; hifleri geniş ve büyük ölçüde enine duvarları (senositik) olmayan yapıdadır. Genom ölçekli filogenetik analizler, bu özellikleri paylaşan taksonların tek bir klad oluşturmadığını göstermiş, bu da onların tek bir Zygomycota filumu yerine Mucoromycota filumuna ve birkaç müttefik filuma yeniden sınıflandırılmasına yol açmıştır (Spatafora ve ark., 2016), böylece Hibbett ve ark. (2007) tarafından önerilen daha önceki üst düzey şema geliştirilmiştir. Bu mantarların geniş, seyrek septalı hifleri, doku kesitlerinde onlara ayırt edici bir görünüm kazandırmaktadır (Guarner & Brandt, 2011).
Klinik önem
Mucorales takımının üyeleri, yönetilmesi zor olduğu bilinen invaziv bir enfeksiyon olan mukormikozun etkenleridir (Katragkou ve ark., 2014) ve karakteristik geniş, kurdele benzeri, seyrek septalı hifleri, histopatolojide tanınmasına yardımcı olmaktadır (Guarner & Brandt, 2011). Bu giriş, bu mantarları tanımlanabilir kılan sınıflandırma ve morfolojiyi açıklamaktadır ve bireysel tanı veya tedavi önerileri için bir kaynak değildir.
Kanıt ve kılavuzlar
Eski zigomiçetlerin mevcut sınıflandırması, Hibbett ve ark. (2007) tarafından önerilen daha önceki alem çapındaki şemaya karşılık, Spatafora ve ark. (2016) tarafından yapılan genom ölçekli filum düzeyindeki revizyonu takip etmektedir. Mucorales için klinik ve histopatolojik bağlam, Guarner ve Brandt (2011) ile Katragkou ve ark. (2014) çalışmalarından alınmıştır.
Tarihçe
Yirminci yüzyılın büyük bir bölümünde, Zygomycota filumu, zigospore üreten mantarları bir araya getirmiş ve Mucorales, en iyi bilinen takımı olmuştur. DNA tabanlı filogeniler biriktikçe, grubun birkaç farklı soyun yapay bir birleşimi olduğu ortaya çıkmıştır; Hibbett ve ark. (2007) tarafından yapılan üst düzey sınıflandırma zaten bu istikrarsızlığı işaret etmiş ve Spatafora ve ark. (2016) tarafından yapılan genom ölçekli analiz, 'Zygomycota' adını resmen Mucoromycota ve müttefik filumlarla değiştirmiştir.
Tartışmalar
- 'Zygomycota' geçerli bir filum mudur?
- Genom ölçekli filogenetik çalışmalar, zigospore oluşturan mantarların diğerlerini dışlayacak şekilde tek bir ortak atayı paylaşmadığını göstermektedir, bu nedenle filum dağıtılmış ve üyeleri Mucoromycota ve müttefik filumlara yeniden atanmıştır; eski isim gayri resmi olarak varlığını sürdürmektedir.
Öne çıkan isimler
- Joseph W. Spatafora
- Gerald L. Benny
- David Hibbett
- Jason E. Stajich
İlgili konular
Temel eserler
- spatafora-2016
- hibbett-2007
Sıkça sorulan sorular
- 'Zygomycota' hala tanınan bir filum mudur?
- Hayır. Genom ölçekli çalışmalar, bunun tek bir doğal soy olmadığını göstermiş ve üyeleri esas olarak Mucoromycota filumuna ve birkaç müttefik erken ayrılan filuma yeniden atanmıştır, ancak zigomiçetler terimi gayri resmi kullanımda kalmaktadır.
- Zigomiçet hiflerini ayıran nedir?
- Bunlar tipik olarak geniş ve senositiktir, yani az sayıda veya hiç enine duvarı (septum) yoktur, bu da onlara Dikarya'nın düzenli septalı hiflerine kıyasla karakteristik geniş, kurdele benzeri bir görünüm vermektedir.