RNA Velocity
RNA velocity เป็นระเบียบวิธีเชิงคำนวณที่อนุมานสถานะการพัฒนาในอนาคตของเซลล์แต่ละเซลล์จากข้อมูลการจัดลำดับ RNA ของเซลล์เดี่ยว (single-cell RNA-sequencing data) ระเบียบวิธีนี้พัฒนาโดย La Manno และคณะในปี 2018 การวิเคราะห์ RNA velocity วัดทิศทางและอัตราการเปลี่ยนแปลงสถานะของเซลล์โดยการวิเคราะห์อัตราส่วนของทรานสคริปต์ mRNA ที่ยังไม่ได้ถูกตัดต่อ (unspliced) ต่อทรานสคริปต์ mRNA ที่ถูกตัดต่อแล้ว (spliced) ภายในเซลล์แต่ละเซลล์ สิ่งนี้ช่วยให้สามารถคาดการณ์วิถีของเซลล์ (cell trajectories) และเส้นทางการจำแนกเซลล์ (differentiation pathways) โดยไม่จำเป็นต้องมีการสุ่มตัวอย่างตามเวลาหรือการจัดการทดลอง ทำให้ได้ข้อมูลเชิงลึกที่ไม่เหมือนใครเกี่ยวกับการตัดสินใจเกี่ยวกับชะตากรรมของเซลล์ (cell fate decisions) ในระหว่างการพัฒนาและโรค
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/th/genetics/rna-velocity
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การวิเคราะห์ ATAC-seqพันธุศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์ Hi-Cพันธุศาสตร์↔ เปรียบเทียบ