Process / pipelineBioinformatics / omics
การวิเคราะห์ eQTL อนุกรมเวลา — การควบคุมทางพันธุกรรมแบบไดนามิกของการแสดงออกของยีน
การวิเคราะห์ eQTL อนุกรมเวลา (Time-series eQTL analysis) ระบุตัวแปรทางพันธุกรรม (eQTLs) ที่ผลกระทบต่อการแสดงออกของยีนเปลี่ยนแปลงไปตามกาลเวลาหรือช่วงพัฒนาการต่างๆ โดยการรวมข้อมูล RNA-seq ตามยาวเข้ากับจีโนไทป์ของแต่ละบุคคล วิธีการนี้สามารถจับภาพได้ว่า SNP เดียวกันสามารถกระตุ้น ยับยั้ง หรือปรับเปลี่ยนการควบคุมยีน ณ จุดเวลาที่แตกต่างกันได้อย่างไร ซึ่งเผยให้เห็นสถาปัตยกรรมเชิงเวลาของโปรแกรมการควบคุมของจีโนมในกระบวนการต่างๆ เช่น การจำแนกเซลล์ การลุกลามของโรค และการตอบสนองต่อสิ่งแวดล้อม
▶เปิดใน MethodMindเร็ว ๆ นี้►วิดีโอเร็ว ๆ นี้▦Download slides อ่านวิธีฉบับเต็ม
สำหรับสมาชิกเท่านั้นเข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
เข้าสู่ระบบMethod map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Fair, B. J., et al. (2020). Gene expression variability in human and chimpanzee populations share common determinants. eLife, 9, e59929. link ↗
- Strober, B. J., et al. (2019). Dynamic genetic regulation of gene expression during cellular differentiation. Science, 364(6447), 1287–1290. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/time-series-eqtl-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
Compare side by side →พบปัญหาในหน้านี้หรือไม่ แจ้งหรือเสนอการแก้ไข →