Process / pipelineBioinformatics / omics

Uchanganuzi wa Mabadiliko ya Idadi Nakala za Kiini Kimoja

Uchanganuzi wa mabadiliko ya idadi nakala za kiini kimoja (scCNV) hugundua upatikanaji na upotevu wa sehemu za jenomu ndani ya viini binafsi, ikiwawezesha watafiti kutatua utofauti ndani ya uvimbe, kujenga upya mageuzi ya koo, na kutofautisha seli mbaya kutoka kwa seli za kawaida kwa azimio la kiini kimoja. Inaweza kutumika kwa data ya upimaji jenomu nzima ya kiini kimoja moja kwa moja au kutokana na mawimbi ya kina cha usomaji katika majaribio ya scRNA-seq au scATAC-seq.

Fungua katika MethodMindHivi karibuniVideoHivi karibuniPakua slaidi

Soma mbinu kamili

Kwa wanachama pekee

Ingia kwa akaunti ya bure ili kusoma sehemu hii.

Ingia

Ramani ya mbinu

Jirani ya mbinu zinazohusiana — chagua nodi ili kuchunguza.

Uchanganuzi wa Mabadiliko ya Idadi Nakala za Kiini Kimoja

Uchambuzi wa Tofauti za…Utafiti wa jumla wa epig…Uchambuzi wa GWAS wa sel…Uchanganuzi wa RNA-seq w…Uchanganuzi wa Kuonyesha…Upigaji wa Vigezo Uchanganuzi wa Mfumo wa…Uchambuzi wa Tofauti ya…Uchanganuzi wa Mabadilik…

Vyanzo

Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗

Jinsi ya kunukuu ukurasa huu

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sw/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis

Mbinu ipi?

Weka mbinu hii kando ya jamaa zake wa karibu na uzisome bega kwa bega — maktaba huweka vitabu mezani; uamuzi ni wako.

Uchambuzi wa Tofauti za Idadi ya NakalaBioinformatiki↔ linganisha
Utafiti wa jumla wa epigenome wa seli moja (scEWAS)Bioinformatiki↔ linganisha
Uchambuzi wa GWAS wa seli mojaBioinformatiki↔ linganisha
Uchanganuzi wa RNA-seq wa seli mojaBioinformatiki↔ linganisha
Uchanganuzi wa Kuonyesha Tofauti kwa RNA-seq ya Kiini KimojaBioinformatiki↔ linganisha
Upigaji wa VigezoBioinformatiki↔ linganisha

Linganisha bega kwa bega →

Imerejelewa na

Uchanganuzi wa Mfumo wa Kiasi cha DNA kwa njia ya Bayesian Uchambuzi wa Tofauti za Idadi ya Nakala Uchambuzi wa Tofauti ya Idadi ya Nakala kwa Msaada wa Kujifunza kwa Mashine Uchanganuzi wa Mabadiliko ya Idadi ya Nakala kwa Wakati

Umeona tatizo kwenye ukurasa huu? Ripoti au pendekeza marekebisho →