Analiza e RNA-seq me një qelizë në seri kohore — Transkriptomika e përkohshme në rezolucion njëqelizor
Analiza e RNA-seq me një qelizë në seri kohore kap shprehjen e gjeneve në pika të shumta kohore në rezolucion njëqelizor për të zbuluar se si popullatat qelizore shfaqen, kalojnë dhe ndahen gjatë proceseve biologjike dinamike si zhvillimi, diferencimi ose përparimi i sëmundjes. Duke kombinuar renditjen pseudokohore, shpejtësinë e RNA-së dhe testimin e dinamikës diferenciale, studiuesit rindërtojnë trajektoren e përkohshme të qelizave individuale dhe identifikojnë ndryshimet rregullatore gjenetike që nxisin tranzicionet biologjike.
Lexoni metodën e plotë
Hyni me një llogari falas për ta lexuar këtë seksion.
Harta e metodave
Lagjja e metodave të lidhura — zgjidhni një nyje për të eksploruar.
Burimet
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Si ta citoni këtë faqe
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sq/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Cila metodë?
Vendoseni këtë metodë pranë të afërmeve të saj më të ngushta dhe lexojini krah për krah — biblioteka i shtron librat mbi tryezë; zgjedhja është e juaja.
- Analiza e Variacionit të Numrit të KopjeveBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza eQTLBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e Pasurimit të Grupeve Gjenetike (GSEA)Bioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e Pasurimit të ShtigjeveBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e shprehjes diferenciale të RNA-seqBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e RNA-seq me një qelizëBioinformatikë↔ krahaso
Cituar nga
Similar methods
Vutë re një problem në këtë faqe? Raportojeni ose sugjeroni një korrigjim →