Analiza Filogjenetike me Një Qelizë — Rikonstruksioni i Pemës së Linjës Qelizore në Rezolucion Një-Qelizor
Analiza filogjenetike me një qelizë rikonstrukton pemë evolucionare ose zhvillimore nga të dhënat e sekuencimit me një qelizë, duke gjurmuar se si qelizat individuale divergjuan nga një paraardhës i përbashkët. Duke shfrytëzuar mutacionet somatike, barkodet e futura nga CRISPR, ose ndryshimet e numrit të kopjeve si karaktere të trashëgueshme, kjo metodë harton marrëdhëniet klonale brenda tumoreve, indeve në zhvillim, ose repertorëve imunitarë me një rezolucion qelizor të pashembullt.
Lexoni metodën e plotë
Hyni me një llogari falas për ta lexuar këtë seksion.
Harta e metodave
Lagjja e metodave të lidhura — zgjidhni një nyje për të eksploruar.
Burimet
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Si ta citoni këtë faqe
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/sq/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Cila metodë?
Vendoseni këtë metodë pranë të afërmeve të saj më të ngushta dhe lexojini krah për krah — biblioteka i shtron librat mbi tryezë; zgjedhja është e juaja.
- Analiza e Variacionit të Numrit të KopjeveBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza FilogjenetikeBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e RNA-seq me një qelizëBioinformatikë↔ krahaso
- Identifikimi i VarianteveBioinformatikë↔ krahaso
Vutë re një problem në këtë faqe? Raportojeni ose sugjeroni një korrigjim →