Analiza e shprehjes diferenciale të RNA-seq të serive kohore — Transkriptomika Temporale

Analiza e shprehjes diferenciale të RNA-seq të serive kohore identifikon gjene, nivelet e shprehjes së të cilave ndryshojnë sistematikisht në pika kohore të renditura — siç ndodh gjatë zhvillimit, përparimit të sëmundjes ose përgjigjes ndaj një trajtimi. Ndryshe nga analiza e shprehjes diferenciale me dy kushte, ajo modelon në mënyrë eksplicite strukturën temporale të të dhënave, duke kapur trajektore dinamike të shprehjes gjenetike në vend të një kontrasti të vetëm të pamjes së çastit. Vegla të tilla si maSigPro, ImpulseDE2 dhe splineTimeR janë zhvilluar posaçërisht për këtë dizajn.