Grupimi Metagenomik
Grupimi metagenomik ndan kontiget e montuara nga komunitete komplekse mikrobike në grupe të dallueshme gjenomike, secila duke përfaqësuar një organizëm ose shtam individual. E pionieruar nga Banfield dhe kolegët, ky proces izolon gjenomet e organizmave të vetëm (gjenome të montuara nga metagenoma ose MAGs) nga kampet mjedisore pa kërkuar izolime të kultivuara.
Lexoni metodën e plotë
Hyni me një llogari falas për ta lexuar këtë seksion.
Harta e metodave
Lagjja e metodave të lidhura — zgjidhni një nyje për të eksploruar.
Burimet
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗
Si ta citoni këtë faqe
ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/sq/bioinformatics/metagenomic-binning
Cila metodë?
Vendoseni këtë metodë pranë të afërmeve të saj më të ngushta dhe lexojini krah për krah — biblioteka i shtron librat mbi tryezë; zgjedhja është e juaja.
- Analiza e skriningut CRISPRBioinformatikë↔ krahaso
- Sintetizim Transkriptomik De NovoBioinformatikë↔ krahaso
- Kërkim Profili HMMERBioinformatikë↔ krahaso
Cituar nga
Similar methods
Vutë re një problem në këtë faqe? Raportojeni ose sugjeroni një korrigjim →