Kërkim Profili HMMER
Kërkimi i profilit HMMER identifikon homologë të largët të sekuencave proteinike duke përdorur modele probabilistike të familjeve proteinike, të njohura si Modeli i Fshehur Markovan (HMM) i profilit. Zhvilluar nga Eddy dhe kolegët e tij, kjo metodë kap模式e variacionit të sekuencave brenda familjeve proteinike dhe zbulon homologë me një ndjeshmëri shumë më të lartë se matrica të peshave pozicionale ose alinjime dyshe.
Lexoni metodën e plotë
Hyni me një llogari falas për ta lexuar këtë seksion.
Harta e metodave
Lagjja e metodave të lidhura — zgjidhni një nyje për të eksploruar.
Burimet
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Si ta citoni këtë faqe
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/sq/bioinformatics/hmmer-profile-search
Cila metodë?
Vendoseni këtë metodë pranë të afërmeve të saj më të ngushta dhe lexojini krah për krah — biblioteka i shtron librat mbi tryezë; zgjedhja është e juaja.
- Rikthimi me Krioelektron Mikroskopi (Cryo-EM)Bioinformatikë↔ krahaso
- Grupimi MetagenomikBioinformatikë↔ krahaso
- Lidhja MolekulareBioinformatikë↔ krahaso
Cituar nga
Similar methods
Vutë re një problem në këtë faqe? Raportojeni ose sugjeroni një korrigjim →